More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1004 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 319 aa  649    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  93.42 
 
 		 319 aa  609  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3050  transcriptional regulator, AraC family  62.78 
 
 		 323 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  41.19 
 
 		 321 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 326 aa  242  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 321 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4563  transcriptional regulator, AraC family  35.45 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.409707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1928  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0979151  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  32.36 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  29.84 
 
 		 324 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 329 aa  123  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  28.88 
 
 		 321 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  27.15 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  28.89 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  30.08 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 337 aa  99.8  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 325 aa  99.4  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  25.97 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 322 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 324 aa  96.7  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4995  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 316 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 368 aa  96.3  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.12 
 
 		 385 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4450  transcriptional regulator, AraC family  27.31 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  0.0834018 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  39.42 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  40.29 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  39.42 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  26.71 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  27.5 
 
 		 330 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  25.39 
 
 		 791 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  23.15 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  30.86 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 327 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 316 aa  89.7  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  27.58 
 
 		 330 aa  89.4  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 777 aa  89  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 315 aa  89  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 330 aa  89  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 330 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  29.88 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  25.09 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 317 aa  87  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 339 aa  85.9  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 342 aa  85.9  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2723  helix-turn-helix domain-containing protein  25.64 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.97 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4500  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0550  AraC family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0481  AraC family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974899  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3156  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4958  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 165 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0150  AraC family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3807  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.13417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  27.39 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3102  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5309  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0311783  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.62 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  37.86 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  25.72 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0126  transcriptional regulator, AraC family  40.52 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.338176  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2823  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599889  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3660  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.954099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1512  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0131  transcriptional regulator, AraC family  30.04 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  36.17 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>