More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1928 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1928  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 325 aa  649    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0979151  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4563  transcriptional regulator, AraC family  45.42 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.409707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  35.4 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3050  transcriptional regulator, AraC family  32.7 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 326 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4995  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 316 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 346 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 346 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 346 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 347 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 352 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  26.07 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  26.56 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4500  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  24.14 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  25.25 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3807  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.13417 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3156  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0150  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291508 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  39.42 
 
 		 993 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  39.66 
 
 		 791 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2046  AraC family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2002  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 338 aa  72.4  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 777 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2823  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1695  transcriptional regulator, AraC family  24.7 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4450  transcriptional regulator, AraC family  36.64 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  0.0834018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  23.6 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  27.87 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  29.59 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 389 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  33.79 
 
 		 1343 aa  69.3  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  24.1 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4903  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.93 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  24.1 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  24.1 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4958  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 165 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  25.78 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3102  AraC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  28.62 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0305  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0886  transcriptional regulator, AraC family  35.53 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3134  helix-turn-helix domain-containing protein  25.5 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0498  transcriptional regulator  40.2 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0325  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.91 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6176  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 336 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71170  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 336 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  36.36 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0648  helix-turn-helix domain-containing protein  27.53 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.369087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2723  helix-turn-helix domain-containing protein  23.18 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2723  AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0671245 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  26.51 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4999  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0599  transcriptional regulator  38.61 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  37.61 
 
 		 513 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.04 
 
 		 1396 aa  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4474  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3022  AraC family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1512  AraC family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2657  AraC family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>