More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1512 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1512  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 324 aa  642    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3807  AraC family transcriptional regulator  60.12 
 
 		 325 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.13417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  49.2 
 
 		 322 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 329 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  28.62 
 
 		 324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  27.85 
 
 		 321 aa  122  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  29.77 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  28.8 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6006  hypothetical protein  46.15 
 
 		 145 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.874649  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  27.33 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  25.72 
 
 		 354 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 338 aa  99.4  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  28.21 
 
 		 288 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 319 aa  96.3  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  25.65 
 
 		 319 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 777 aa  93.6  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  26.13 
 
 		 333 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 327 aa  93.6  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 354 aa  92.8  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  25 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 318 aa  92.8  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 319 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 319 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 318 aa  92.8  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 318 aa  92.8  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  26.73 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  24.68 
 
 		 340 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 326 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 326 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 326 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 347 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 318 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 352 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2002  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  26.09 
 
 		 348 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  26.37 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.76 
 
 		 302 aa  86.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  28.01 
 
 		 791 aa  85.9  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  26.28 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 321 aa  85.9  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  27.1 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2046  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 326 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  24.63 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  22.07 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  24.63 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.63 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  22.07 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  22.07 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.63 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4875  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0955854 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  24.26 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.26 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  28.98 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0488  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 186 aa  79  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  24.52 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  27.5 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5718  AraC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6715  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3156  AraC family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4563  transcriptional regulator, AraC family  40.2 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.409707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  22.9 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2146  transcriptional regulator, AraC family  26.44 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0126  transcriptional regulator, AraC family  34.82 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.338176  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2978  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  27.64 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  35.45 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>