More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0981 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 777 aa  745    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 791 aa  1625    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  50.19 
 
 		 810 aa  730    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  56.66 
 
 		 791 aa  890    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  55.46 
 
 		 791 aa  879    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 844 aa  728    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  65.29 
 
 		 491 aa  578  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  65.61 
 
 		 485 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  63.81 
 
 		 479 aa  570  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  63.81 
 
 		 479 aa  572  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  62.59 
 
 		 483 aa  566  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  62.32 
 
 		 479 aa  567  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  62.86 
 
 		 481 aa  560  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  62.29 
 
 		 413 aa  528  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37952  predicted protein  36.25 
 
 		 775 aa  291  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 316 aa  287  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  40 
 
 		 389 aa  257  6e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  37.59 
 
 		 359 aa  243  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  36.83 
 
 		 343 aa  239  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  36.52 
 
 		 345 aa  238  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  37.62 
 
 		 343 aa  238  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  36.61 
 
 		 358 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  30.98 
 
 		 324 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  30.71 
 
 		 320 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  30.17 
 
 		 313 aa  149  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  31.96 
 
 		 416 aa  149  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  31.74 
 
 		 416 aa  147  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  31.74 
 
 		 416 aa  147  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  30.51 
 
 		 347 aa  147  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  29.1 
 
 		 373 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  29.73 
 
 		 316 aa  142  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  29.58 
 
 		 456 aa  139  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  29.67 
 
 		 318 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  29.36 
 
 		 454 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  28.16 
 
 		 315 aa  137  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  29.51 
 
 		 418 aa  136  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  29.41 
 
 		 315 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 330 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 352 aa  129  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 347 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  26.83 
 
 		 312 aa  125  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 346 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 346 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 346 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  27.74 
 
 		 381 aa  120  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 324 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  27.55 
 
 		 443 aa  118  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 329 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  27.91 
 
 		 321 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  25 
 
 		 438 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  27.94 
 
 		 320 aa  115  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  24.76 
 
 		 438 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  29.85 
 
 		 328 aa  115  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  24.52 
 
 		 379 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 327 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  27.47 
 
 		 321 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  27.43 
 
 		 316 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 319 aa  112  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  29.75 
 
 		 324 aa  111  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  28.08 
 
 		 315 aa  111  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 318 aa  111  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  27.97 
 
 		 484 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 326 aa  108  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 326 aa  108  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 321 aa  105  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  24.46 
 
 		 439 aa  105  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 336 aa  104  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 326 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 321 aa  103  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 326 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 326 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  35.54 
 
 		 288 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  26 
 
 		 498 aa  103  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 330 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  29.15 
 
 		 318 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 316 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  26.46 
 
 		 322 aa  102  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 318 aa  102  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  30.96 
 
 		 311 aa  101  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  34.34 
 
 		 363 aa  100  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  24.82 
 
 		 360 aa  99.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 318 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  31.62 
 
 		 318 aa  99.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  27.35 
 
 		 338 aa  98.6  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  27.35 
 
 		 338 aa  98.6  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 330 aa  98.6  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  27.27 
 
 		 412 aa  98.6  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2823  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 332 aa  98.2  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599889  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  27.34 
 
 		 479 aa  97.4  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 324 aa  97.8  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  45.28 
 
 		 340 aa  97.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  29.05 
 
 		 315 aa  95.9  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  29.36 
 
 		 321 aa  95.9  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.36 
 
 		 314 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  27.36 
 
 		 336 aa  95.1  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 318 aa  94.7  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  33 
 
 		 312 aa  94.4  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  33 
 
 		 312 aa  93.6  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 337 aa  93.2  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 325 aa  93.6  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>