172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06140 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  74.94 
 
 
454 aa  644    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  100 
 
 
456 aa  900    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  75.42 
 
 
416 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  75.42 
 
 
416 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  74.94 
 
 
416 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  52.93 
 
 
418 aa  353  5e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  49.12 
 
 
373 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  47.98 
 
 
381 aa  309  5.9999999999999995e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  46.19 
 
 
363 aa  292  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  44.44 
 
 
443 aa  280  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  45.84 
 
 
412 aa  280  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  44.59 
 
 
479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  31.8 
 
 
485 aa  169  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  32.56 
 
 
359 aa  166  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  31.17 
 
 
491 aa  164  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  31.85 
 
 
345 aa  162  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
777 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  29.95 
 
 
347 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  31.37 
 
 
479 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  30.16 
 
 
479 aa  157  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  31.8 
 
 
481 aa  156  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  31.13 
 
 
479 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  35.26 
 
 
324 aa  153  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 
844 aa  153  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 
810 aa  152  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  30.56 
 
 
358 aa  152  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  31.36 
 
 
343 aa  150  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  32.73 
 
 
316 aa  147  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 
791 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  29.16 
 
 
483 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  30.88 
 
 
791 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  32.64 
 
 
343 aa  144  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  35.31 
 
 
379 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  33.07 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  35.31 
 
 
438 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  35.31 
 
 
438 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  32.11 
 
 
313 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  29.58 
 
 
791 aa  139  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37952  predicted protein  29.36 
 
 
775 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  34.21 
 
 
315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  31.82 
 
 
413 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  30.13 
 
 
312 aa  136  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  27.79 
 
 
439 aa  136  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  34.42 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  33.51 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  31.8 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  29.92 
 
 
316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  26.2 
 
 
484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  25.85 
 
 
360 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  28.87 
 
 
321 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  28.61 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  32.79 
 
 
319 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  32.79 
 
 
319 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  31.6 
 
 
315 aa  107  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  32.79 
 
 
319 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  27.7 
 
 
315 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  32.89 
 
 
314 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  31.32 
 
 
314 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  25.52 
 
 
498 aa  104  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  32.19 
 
 
312 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  31.85 
 
 
312 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  32.12 
 
 
305 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  32.38 
 
 
322 aa  101  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  32.87 
 
 
313 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  27.69 
 
 
303 aa  97.8  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  31.58 
 
 
303 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  31.49 
 
 
314 aa  95.9  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  32.1 
 
 
389 aa  96.3  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  30.3 
 
 
318 aa  95.9  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  29.54 
 
 
304 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  30.85 
 
 
303 aa  93.6  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  28.37 
 
 
304 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  28.37 
 
 
304 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  28.37 
 
 
304 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  31.65 
 
 
332 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  28.27 
 
 
340 aa  92.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  28.72 
 
 
304 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  27.24 
 
 
304 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  28.89 
 
 
388 aa  90.1  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  26.95 
 
 
304 aa  90.1  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  28.47 
 
 
303 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  28.03 
 
 
337 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  27.89 
 
 
330 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  28.01 
 
 
303 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  28.06 
 
 
337 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  25.48 
 
 
305 aa  89  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  27.96 
 
 
304 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  29.97 
 
 
336 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  26.19 
 
 
328 aa  87  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  30.7 
 
 
304 aa  86.7  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  30.24 
 
 
298 aa  86.3  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  28.4 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  27.5 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  29.84 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  26.01 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  28.61 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  27.7 
 
 
337 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  28.85 
 
 
300 aa  84  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  25.34 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  27.34 
 
 
329 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>