176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4455 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  100 
 
 		 418 aa  810    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  56.71 
 
 		 416 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  56.46 
 
 		 416 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  56.46 
 
 		 416 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  55.53 
 
 		 454 aa  362  9e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  53.48 
 
 		 456 aa  355  7.999999999999999e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  54.11 
 
 		 373 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  50.93 
 
 		 381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  51.34 
 
 		 363 aa  305  7e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  50.38 
 
 		 412 aa  299  8e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  46.7 
 
 		 443 aa  280  5e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  45.36 
 
 		 479 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  32.69 
 
 		 485 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  34.17 
 
 		 347 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  32.03 
 
 		 481 aa  162  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  33.69 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  31.5 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  31.07 
 
 		 479 aa  154  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  30.4 
 
 		 479 aa  153  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  31.28 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  32.8 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  37.45 
 
 		 318 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  33.61 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  33.87 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  29.51 
 
 		 791 aa  143  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  33.33 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 777 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  35.74 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 844 aa  140  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  32.78 
 
 		 315 aa  140  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  32.43 
 
 		 359 aa  139  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  33.05 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 810 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  31.78 
 
 		 324 aa  136  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  29.54 
 
 		 439 aa  134  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  31.48 
 
 		 312 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 791 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  38.89 
 
 		 491 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  37.37 
 
 		 483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  32.2 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  34.9 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  40.61 
 
 		 791 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  34.9 
 
 		 438 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  34.9 
 
 		 438 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  34.34 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  35.46 
 
 		 328 aa  120  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  33.58 
 
 		 312 aa  117  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  34.33 
 
 		 313 aa  117  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  36.36 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  29.29 
 
 		 484 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  30.25 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  35.47 
 
 		 319 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  35.47 
 
 		 319 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 		 315 aa  110  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  30.83 
 
 		 316 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  36.23 
 
 		 319 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  34.57 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  34.44 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  30 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  33.45 
 
 		 322 aa  101  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  28.69 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  28.97 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  27.64 
 
 		 360 aa  99.8  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  29.63 
 
 		 303 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37952  predicted protein  33.33 
 
 		 775 aa  97.1  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  30.45 
 
 		 318 aa  94.4  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  24.62 
 
 		 498 aa  94.4  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  31.56 
 
 		 305 aa  94.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  31.92 
 
 		 412 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  32.9 
 
 		 409 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  31.92 
 
 		 412 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  31.92 
 
 		 412 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  30.33 
 
 		 410 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  30.94 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  30.39 
 
 		 303 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  30.15 
 
 		 410 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  30.26 
 
 		 409 aa  90.1  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  29.93 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  34.25 
 
 		 459 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  30.62 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  30.62 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  30.65 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  30.26 
 
 		 410 aa  88.2  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  30.19 
 
 		 410 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  33.33 
 
 		 337 aa  87  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  28.98 
 
 		 303 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  29.67 
 
 		 388 aa  87  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  39.64 
 
 		 389 aa  87  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  28.53 
 
 		 409 aa  86.7  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  28.66 
 
 		 337 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  27.92 
 
 		 329 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  25.77 
 
 		 329 aa  86.3  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  28.66 
 
 		 411 aa  86.3  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  37.57 
 
 		 304 aa  85.9  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  29.47 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  29.43 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  27.04 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  26.07 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  30.15 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  29.28 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>