178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3207 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  100 
 
 
329 aa  679    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  92.1 
 
 
329 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  89.67 
 
 
329 aa  614  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  81.35 
 
 
330 aa  565  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  72.7 
 
 
332 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  58.84 
 
 
328 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  57.06 
 
 
340 aa  397  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  56.44 
 
 
329 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  51.33 
 
 
311 aa  295  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  47.06 
 
 
339 aa  259  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  45.39 
 
 
350 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  44.22 
 
 
342 aa  238  9e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  42.56 
 
 
336 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  42.32 
 
 
339 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  42.17 
 
 
332 aa  228  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  41.67 
 
 
337 aa  226  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  41.23 
 
 
337 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  40.71 
 
 
337 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  38.55 
 
 
366 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  40.46 
 
 
337 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  40.46 
 
 
337 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  37.54 
 
 
303 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  36.84 
 
 
311 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  37.03 
 
 
303 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  35.64 
 
 
304 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  35.29 
 
 
304 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  35.96 
 
 
310 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  34.6 
 
 
304 aa  165  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  35.29 
 
 
304 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  34.6 
 
 
304 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  34.6 
 
 
303 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  34.6 
 
 
304 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  34.86 
 
 
301 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  34.26 
 
 
303 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  34.95 
 
 
304 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  32.44 
 
 
304 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  33.22 
 
 
303 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  34.01 
 
 
319 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  34.9 
 
 
305 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  33.67 
 
 
319 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  33.67 
 
 
319 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  31.12 
 
 
291 aa  152  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  35.35 
 
 
304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  32.92 
 
 
315 aa  145  9e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  32.14 
 
 
314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  30.3 
 
 
314 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  32.37 
 
 
322 aa  138  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  34.64 
 
 
303 aa  138  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  29.47 
 
 
305 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  32.19 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2320  Acetamidase/Formamidase  32.12 
 
 
429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.167925  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2307  acetamidase/formamidase  31.56 
 
 
429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213262  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  34.25 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  32.12 
 
 
429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  33.45 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  34.25 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  33.56 
 
 
314 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2066  acetamidase/formamidase  32.23 
 
 
429 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00155819  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  29.55 
 
 
298 aa  132  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  30.46 
 
 
313 aa  132  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  29.25 
 
 
300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  32.81 
 
 
318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  30.87 
 
 
312 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  30.2 
 
 
312 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  32.79 
 
 
312 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  31.17 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  30.23 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  34.63 
 
 
439 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  30.06 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  32.13 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  30.28 
 
 
347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  30.9 
 
 
305 aa  113  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  29.13 
 
 
321 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  29.13 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  27.83 
 
 
359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  29.45 
 
 
316 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  29.48 
 
 
313 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  29.49 
 
 
318 aa  105  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  29.48 
 
 
315 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  28.43 
 
 
343 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  31.89 
 
 
484 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  26.05 
 
 
345 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 
777 aa  99.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  28.26 
 
 
491 aa  99.4  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  27.6 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  27.8 
 
 
343 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  32.32 
 
 
485 aa  96.3  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  27.02 
 
 
479 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  29.74 
 
 
438 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  29.74 
 
 
438 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  27.3 
 
 
363 aa  95.1  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  29.74 
 
 
379 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  29.96 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  26.4 
 
 
479 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  25.4 
 
 
388 aa  93.2  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  31.98 
 
 
479 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  24.17 
 
 
360 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  25.7 
 
 
481 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
810 aa  89.4  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  31.31 
 
 
791 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.300542 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>