165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3443 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  100 
 
 		 321 aa  640    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  97.51 
 
 		 321 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  88.85 
 
 		 316 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  67.52 
 
 		 315 aa  414  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  46.65 
 
 		 320 aa  269  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  46.35 
 
 		 318 aa  268  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  43.37 
 
 		 312 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  46.65 
 
 		 316 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  45.57 
 
 		 315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  43.31 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  43.4 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  39.62 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  34.48 
 
 		 347 aa  188  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  35.6 
 
 		 439 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  37.89 
 
 		 379 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  37.89 
 
 		 438 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  37.58 
 
 		 438 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  35.9 
 
 		 484 aa  159  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  30.84 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  29.39 
 
 		 358 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  29.73 
 
 		 359 aa  149  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  32.13 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  31.2 
 
 		 483 aa  145  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  31.53 
 
 		 343 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 844 aa  143  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  32.76 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  30.77 
 
 		 481 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  35.91 
 
 		 305 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  30.97 
 
 		 373 aa  135  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  35.81 
 
 		 319 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  32.33 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  38.75 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  38.75 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  29.34 
 
 		 479 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  29.34 
 
 		 479 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  40.27 
 
 		 311 aa  132  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  29.19 
 
 		 479 aa  132  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  34.24 
 
 		 312 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  33 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  30.56 
 
 		 413 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  28.47 
 
 		 485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  30.33 
 
 		 322 aa  129  7.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  33.56 
 
 		 312 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 810 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  31.73 
 
 		 443 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  33.43 
 
 		 363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  28.39 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  33.9 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  34.68 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  32.18 
 
 		 301 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 777 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  28.37 
 
 		 491 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  31.95 
 
 		 328 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  32.19 
 
 		 314 aa  123  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  36.13 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  27.66 
 
 		 791 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  35.32 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  28.57 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  34.7 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  28.16 
 
 		 498 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  33.9 
 
 		 332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  37.29 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 791 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  29.1 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  28.92 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  29.63 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  31.83 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  29.97 
 
 		 416 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  31.49 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  29.97 
 
 		 416 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  29.97 
 
 		 416 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  27.91 
 
 		 791 aa  115  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  28.23 
 
 		 454 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  28.61 
 
 		 456 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2307  acetamidase/formamidase  32.15 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213262  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  28.52 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  34.91 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2320  Acetamidase/Formamidase  32.15 
 
 		 429 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.167925  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  29.13 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  32.15 
 
 		 429 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  31.27 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2066  acetamidase/formamidase  32.15 
 
 		 429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00155819  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  30.36 
 
 		 332 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  31.01 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  30.94 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  32.17 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  32.68 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  34.87 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  34.96 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  30.87 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  31.42 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  27.18 
 
 		 329 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  32.8 
 
 		 366 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  30.88 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  30.45 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  32.8 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  32.8 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  28.29 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  30 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  27.05 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>