167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2320 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2307  acetamidase/formamidase  98.83 
 
 
429 aa  872    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213262  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  99.53 
 
 
429 aa  880    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2066  acetamidase/formamidase  98.37 
 
 
429 aa  867    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00155819  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2320  Acetamidase/Formamidase  100 
 
 
429 aa  885    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.167925  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  40.26 
 
 
310 aa  207  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  40.33 
 
 
311 aa  206  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  36.54 
 
 
303 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  34.67 
 
 
303 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  34.3 
 
 
311 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  31.69 
 
 
340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  34.56 
 
 
339 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  34 
 
 
329 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  32.12 
 
 
329 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  32.49 
 
 
291 aa  133  7.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  30.87 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  30.13 
 
 
329 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  31.69 
 
 
332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  38.01 
 
 
332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  30.62 
 
 
329 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  30 
 
 
330 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  32.75 
 
 
337 aa  123  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  32.52 
 
 
337 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  31.51 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  31.51 
 
 
285 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  32.33 
 
 
342 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  29.49 
 
 
305 aa  119  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  33.45 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  33.22 
 
 
337 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  33.22 
 
 
337 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  33 
 
 
439 aa  119  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  26.58 
 
 
347 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  31.7 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  31.44 
 
 
350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  30.35 
 
 
316 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  30.21 
 
 
304 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  31.44 
 
 
336 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  31.29 
 
 
315 aa  114  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  32.85 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  31.51 
 
 
321 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  28.53 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  29.36 
 
 
304 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  32.15 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  28.06 
 
 
359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  29.79 
 
 
303 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  27.6 
 
 
304 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  34.98 
 
 
315 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  29.79 
 
 
304 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  29.79 
 
 
304 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  29.79 
 
 
304 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  29.79 
 
 
303 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  31.42 
 
 
305 aa  107  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  29.87 
 
 
315 aa  107  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  29.79 
 
 
304 aa  106  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  28.94 
 
 
304 aa  106  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  29.45 
 
 
320 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  34.09 
 
 
484 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  31.35 
 
 
301 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  28.57 
 
 
304 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  26.69 
 
 
360 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  31.01 
 
 
339 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  29.27 
 
 
312 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  26.82 
 
 
358 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  28.94 
 
 
315 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  29.02 
 
 
300 aa  95.9  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  26.27 
 
 
345 aa  95.5  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  26.09 
 
 
299 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  27.61 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  31.06 
 
 
438 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  31.86 
 
 
324 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  31.06 
 
 
438 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  28.85 
 
 
313 aa  93.6  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  31.01 
 
 
379 aa  93.6  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  25.29 
 
 
498 aa  93.6  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  28.76 
 
 
303 aa  92.8  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  27.99 
 
 
298 aa  91.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  29.96 
 
 
314 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  27.61 
 
 
343 aa  89.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  29.25 
 
 
314 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  28.89 
 
 
373 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  29.29 
 
 
314 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  28.28 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  28.28 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  27.99 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  27.15 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  28.14 
 
 
303 aa  82.4  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  30 
 
 
322 aa  82.8  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  27.49 
 
 
313 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  27.39 
 
 
312 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 
777 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  26.92 
 
 
312 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  27.96 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0100916 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  29.63 
 
 
318 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  31.55 
 
 
791 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  27.85 
 
 
416 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  27.85 
 
 
416 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  27.52 
 
 
416 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  32.46 
 
 
456 aa  79  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  28.4 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  29.53 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  30.13 
 
 
418 aa  77  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>