175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3711 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  100 
 
 
328 aa  659    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  47.68 
 
 
314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  43.79 
 
 
322 aa  273  3e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  47.6 
 
 
319 aa  268  7e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  47.6 
 
 
319 aa  268  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  47.6 
 
 
319 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  46.82 
 
 
314 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47216 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  43.37 
 
 
318 aa  258  1e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  46.69 
 
 
314 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  45.6 
 
 
312 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  45.28 
 
 
312 aa  256  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  45.36 
 
 
315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  44.48 
 
 
313 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  39 
 
 
393 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  33.88 
 
 
388 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  36.94 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  40.37 
 
 
320 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  39.76 
 
 
316 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  37.74 
 
 
313 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  39.51 
 
 
315 aa  165  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  33.55 
 
 
439 aa  159  6e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  39.29 
 
 
305 aa  156  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  36.96 
 
 
312 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  34.5 
 
 
347 aa  152  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  31.4 
 
 
459 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  36.16 
 
 
315 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  36.25 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  34.42 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  34.42 
 
 
318 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  31.63 
 
 
415 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  29.41 
 
 
397 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  34.17 
 
 
330 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  30.61 
 
 
418 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  33.43 
 
 
358 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  28.57 
 
 
406 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  29.47 
 
 
418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  32.49 
 
 
329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  31.27 
 
 
291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  33.14 
 
 
343 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  32.78 
 
 
301 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  29.54 
 
 
410 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  32.19 
 
 
345 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  30.67 
 
 
360 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  35.84 
 
 
298 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  30.85 
 
 
416 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  28.35 
 
 
408 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  30.87 
 
 
299 aa  137  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  28.99 
 
 
417 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  28.99 
 
 
417 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  33.05 
 
 
401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  28.99 
 
 
417 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  29.41 
 
 
414 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  32.19 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  34.15 
 
 
359 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  28.46 
 
 
410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  33.76 
 
 
300 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  31.19 
 
 
484 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  29.11 
 
 
418 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  28.26 
 
 
411 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  36.79 
 
 
332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  31.46 
 
 
329 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  33.84 
 
 
438 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  29.38 
 
 
409 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  33.84 
 
 
438 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  29.11 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  29.11 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  29.11 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  28.39 
 
 
417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  28.99 
 
 
417 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  29.46 
 
 
409 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  29.46 
 
 
409 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  33.46 
 
 
379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  32.86 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  32.72 
 
 
777 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  28.42 
 
 
410 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  38.89 
 
 
363 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  32.99 
 
 
285 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  28.73 
 
 
409 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  32.99 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  33.44 
 
 
316 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  28.38 
 
 
409 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  31.31 
 
 
304 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  31.65 
 
 
304 aa  125  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  28.19 
 
 
410 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  32.3 
 
 
479 aa  125  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  30.58 
 
 
329 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  33.11 
 
 
340 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  28.61 
 
 
409 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  34.88 
 
 
416 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  28.28 
 
 
305 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  28.92 
 
 
409 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  27.65 
 
 
408 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  32.3 
 
 
479 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  28.3 
 
 
410 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  34.88 
 
 
416 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  34.88 
 
 
416 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  33.56 
 
 
303 aa  123  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  31.95 
 
 
321 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  31.95 
 
 
321 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  31.8 
 
 
456 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>