178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2928 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  100 
 
 
303 aa  625  1e-178  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  39.86 
 
 
301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  39.08 
 
 
304 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  39.08 
 
 
304 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  38.73 
 
 
304 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  38.73 
 
 
303 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  38.38 
 
 
303 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  37.68 
 
 
304 aa  188  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  38.04 
 
 
304 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  37.68 
 
 
304 aa  185  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  37.59 
 
 
304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  37.68 
 
 
304 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  35.29 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  36.24 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  33.09 
 
 
299 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  36.27 
 
 
285 aa  170  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  35.92 
 
 
285 aa  168  8e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  35.57 
 
 
298 aa  163  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  36.33 
 
 
300 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  33.94 
 
 
304 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  32.76 
 
 
303 aa  145  8.000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  32.91 
 
 
350 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  33.93 
 
 
330 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  33.57 
 
 
329 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  34.64 
 
 
329 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  36.49 
 
 
305 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  34.3 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  32.38 
 
 
340 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  32.16 
 
 
339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  31.88 
 
 
336 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  32.1 
 
 
311 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  31.52 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  30.71 
 
 
339 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  31.91 
 
 
342 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  32.29 
 
 
314 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  30.21 
 
 
311 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  30.47 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  31.48 
 
 
337 aa  116  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  30.24 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  30.24 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  30.24 
 
 
319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  28.47 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  30.72 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  30.38 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  28.47 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  31 
 
 
337 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  31.99 
 
 
366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  31.95 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  31.99 
 
 
337 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  31.99 
 
 
337 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  30.99 
 
 
337 aa  112  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  38.99 
 
 
345 aa  112  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  31.76 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  30.03 
 
 
315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  30.6 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  29.62 
 
 
332 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  31.82 
 
 
318 aa  108  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  33.63 
 
 
316 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  34.1 
 
 
303 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  34.05 
 
 
316 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  29.05 
 
 
313 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  32.13 
 
 
359 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  32.14 
 
 
343 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  32.88 
 
 
315 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 
777 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  29.92 
 
 
358 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  32.54 
 
 
343 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  33.78 
 
 
320 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  33.63 
 
 
313 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  29.78 
 
 
324 aa  99.4  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  32.46 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  32.85 
 
 
314 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  32.14 
 
 
321 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  27.24 
 
 
439 aa  96.7  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  31.84 
 
 
321 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  30.67 
 
 
479 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  30.87 
 
 
491 aa  95.9  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  34.78 
 
 
305 aa  93.2  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  33.33 
 
 
479 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  29.9 
 
 
481 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 
479 aa  92  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  29.19 
 
 
485 aa  92  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  28.72 
 
 
318 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  29.29 
 
 
363 aa  91.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  31.25 
 
 
347 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  28.63 
 
 
791 aa  90.5  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  29.73 
 
 
315 aa  89  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  32.22 
 
 
483 aa  88.2  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  27.27 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  30.16 
 
 
791 aa  85.5  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 
791 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  29.55 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  28.57 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  31.05 
 
 
844 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  26.76 
 
 
416 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 
810 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  30.56 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  30.95 
 
 
409 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  26.41 
 
 
416 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>