173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1574 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  100 
 
 		 498 aa  1032    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  44.7 
 
 		 484 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  39.72 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  32.58 
 
 		 360 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  31.18 
 
 		 438 aa  156  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  31.18 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  31.18 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  32.95 
 
 		 316 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  31.98 
 
 		 315 aa  149  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  29.7 
 
 		 347 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  30.17 
 
 		 359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  32.17 
 
 		 320 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  30.7 
 
 		 345 aa  144  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  30.97 
 
 		 343 aa  144  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  30.55 
 
 		 343 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  29.75 
 
 		 358 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  30.4 
 
 		 313 aa  136  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  31.23 
 
 		 315 aa  134  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  29.38 
 
 		 312 aa  134  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  27.59 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  29.46 
 
 		 373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  30.57 
 
 		 318 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  29.26 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  31.37 
 
 		 324 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  29.6 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  28.16 
 
 		 321 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  26.77 
 
 		 443 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  28.9 
 
 		 316 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  26.33 
 
 		 301 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  28.5 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  26.11 
 
 		 416 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  26.11 
 
 		 416 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  26.11 
 
 		 416 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  29.85 
 
 		 303 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  25.85 
 
 		 454 aa  106  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  27.58 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  28.05 
 
 		 328 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  31.1 
 
 		 318 aa  104  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  25.52 
 
 		 456 aa  104  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  25.77 
 
 		 313 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  28.83 
 
 		 285 aa  103  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  26 
 
 		 791 aa  103  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  27.76 
 
 		 303 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  28.83 
 
 		 285 aa  103  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  27.71 
 
 		 299 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  25.61 
 
 		 312 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  24.23 
 
 		 312 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  26.73 
 
 		 791 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  24.83 
 
 		 483 aa  99.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  31.95 
 
 		 314 aa  99.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  26.75 
 
 		 304 aa  99  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  26.44 
 
 		 339 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  27.5 
 
 		 291 aa  98.6  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  25.38 
 
 		 491 aa  97.4  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  31.33 
 
 		 315 aa  96.7  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 791 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  28.53 
 
 		 332 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  26.32 
 
 		 413 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  25.58 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2066  acetamidase/formamidase  25.58 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00155819  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 777 aa  94.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  31.15 
 
 		 314 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2307  acetamidase/formamidase  25.58 
 
 		 429 aa  94.4  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213262  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  28.76 
 
 		 298 aa  93.6  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2320  Acetamidase/Formamidase  25.29 
 
 		 429 aa  93.2  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.167925  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  27.86 
 
 		 412 aa  93.2  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  26.72 
 
 		 304 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  29.36 
 
 		 314 aa  90.9  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  25.63 
 
 		 418 aa  90.9  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  27.7 
 
 		 340 aa  90.1  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  25.09 
 
 		 322 aa  89.7  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  29.39 
 
 		 388 aa  89.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  25.42 
 
 		 481 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  25.15 
 
 		 300 aa  88.6  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  25.46 
 
 		 479 aa  89  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 844 aa  88.2  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  25.18 
 
 		 485 aa  88.2  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  25.23 
 
 		 479 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  25.93 
 
 		 330 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  28.92 
 
 		 393 aa  87.8  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  24.77 
 
 		 479 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  26.05 
 
 		 311 aa  87.4  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  24.81 
 
 		 304 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  24.43 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  24.81 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  24.81 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  24.43 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  24.43 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  28.16 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  25 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  27.2 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  25.06 
 
 		 810 aa  84  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  26.67 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  24.05 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  31.77 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  23.94 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  23.66 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  23.66 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  25.38 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  25.38 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>