178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0290 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  100 
 
 
373 aa  758    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  54.2 
 
 
381 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  53.8 
 
 
363 aa  348  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  49.73 
 
 
443 aa  335  7e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  54.11 
 
 
418 aa  332  5e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  49.12 
 
 
456 aa  318  7.999999999999999e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  48.04 
 
 
454 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  46.48 
 
 
416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  46.48 
 
 
416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  46.23 
 
 
416 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  50.82 
 
 
412 aa  298  7e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  48.78 
 
 
479 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  33.7 
 
 
439 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  36.21 
 
 
320 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  34.92 
 
 
347 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  34.9 
 
 
312 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  37.99 
 
 
315 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  35.13 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  35.65 
 
 
316 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  32.96 
 
 
358 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  36.62 
 
 
315 aa  170  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  33.24 
 
 
345 aa  168  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  33.7 
 
 
343 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  34.62 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  35.61 
 
 
318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  31.94 
 
 
359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  30.66 
 
 
491 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  32.96 
 
 
484 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  29.5 
 
 
485 aa  160  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  30.41 
 
 
479 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  30.41 
 
 
479 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  32.55 
 
 
844 aa  160  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  33.14 
 
 
324 aa  159  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  30.17 
 
 
479 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  30.15 
 
 
481 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
777 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  28.61 
 
 
483 aa  153  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  30.57 
 
 
791 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 
791 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  30.49 
 
 
413 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 
810 aa  146  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  29.1 
 
 
791 aa  143  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  36.61 
 
 
438 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  36.61 
 
 
438 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  31.53 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  36.61 
 
 
379 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  31.82 
 
 
316 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  30.97 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  29.46 
 
 
498 aa  129  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  31.62 
 
 
360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  34.47 
 
 
313 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  30.77 
 
 
315 aa  125  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  32.52 
 
 
322 aa  124  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  30.17 
 
 
312 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  36.3 
 
 
328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  29.6 
 
 
312 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  29.39 
 
 
303 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37952  predicted protein  25.66 
 
 
775 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  32.12 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  30.82 
 
 
314 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  32.95 
 
 
315 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  27.65 
 
 
305 aa  113  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  28.09 
 
 
318 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  33.58 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  28.08 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  31.19 
 
 
319 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  31.19 
 
 
319 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  30.85 
 
 
319 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  32.95 
 
 
314 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  32.17 
 
 
314 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  28.74 
 
 
303 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  28.74 
 
 
304 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  28.74 
 
 
303 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  28.74 
 
 
304 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  26.25 
 
 
304 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  28.74 
 
 
304 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  28.48 
 
 
303 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  29.02 
 
 
337 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  29.82 
 
 
337 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  29.66 
 
 
304 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  27.65 
 
 
303 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  26.97 
 
 
301 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  29.18 
 
 
304 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  28.2 
 
 
311 aa  99.4  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  29.18 
 
 
304 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  27.55 
 
 
340 aa  97.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  31.54 
 
 
304 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  27.52 
 
 
304 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  27.92 
 
 
329 aa  97.1  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  27.11 
 
 
300 aa  95.5  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  27.72 
 
 
337 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  29.96 
 
 
299 aa  95.9  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  29.32 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  28.95 
 
 
285 aa  93.2  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  27.59 
 
 
332 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  26.65 
 
 
328 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  29.82 
 
 
337 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  29.82 
 
 
337 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  29.82 
 
 
366 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  42.34 
 
 
389 aa  89.7  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>