171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4612 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  100 
 
 		 324 aa  659    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  43.85 
 
 		 313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  44.68 
 
 		 318 aa  239  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  42.19 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  42.5 
 
 		 320 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  40.9 
 
 		 438 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  40.9 
 
 		 438 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  40.88 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  42.99 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  40.72 
 
 		 379 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  42.22 
 
 		 316 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  38.55 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  38.64 
 
 		 345 aa  215  7e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  39.05 
 
 		 343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  38.39 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  38.12 
 
 		 358 aa  209  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  41.01 
 
 		 315 aa  209  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  40.25 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  34.66 
 
 		 347 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  39.31 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  39.62 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 777 aa  186  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  39.56 
 
 		 313 aa  182  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  38.78 
 
 		 484 aa  182  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  36.51 
 
 		 439 aa  182  9.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  37.95 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  38.25 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  36.94 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  30.98 
 
 		 479 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  36.92 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  35.01 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  31.07 
 
 		 479 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  31.22 
 
 		 479 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  36.09 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  31.05 
 
 		 481 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 791 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  33.94 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  30.66 
 
 		 483 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  35.35 
 
 		 319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  35.35 
 
 		 319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  29.71 
 
 		 791 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  35.05 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  39.68 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  33.14 
 
 		 373 aa  159  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  32.17 
 
 		 381 aa  159  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  30.1 
 
 		 413 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  34.49 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  30.98 
 
 		 791 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  34.26 
 
 		 318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  35.26 
 
 		 456 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  30.26 
 
 		 416 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  30.26 
 
 		 416 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 844 aa  153  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  30.26 
 
 		 416 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  30.24 
 
 		 485 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 810 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  30.17 
 
 		 491 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  35.82 
 
 		 363 aa  150  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  31.86 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  29.06 
 
 		 454 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  30.58 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  31.79 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  30 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  29.86 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  29.86 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  29.79 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  29.79 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  29.79 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  35.47 
 
 		 291 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  29.24 
 
 		 443 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  29.43 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  29.64 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  33.92 
 
 		 418 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  29.08 
 
 		 304 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  33.58 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  30.03 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  34.78 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  33.45 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  29.01 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  31.37 
 
 		 498 aa  126  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  33.33 
 
 		 311 aa  122  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  30.82 
 
 		 339 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  32.01 
 
 		 412 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  33.08 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  30.23 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  31.89 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  31.15 
 
 		 393 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  32.42 
 
 		 303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  29.97 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  30.08 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  30.45 
 
 		 303 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  34.08 
 
 		 304 aa  115  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  29.07 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  29.74 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  30.4 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  31.09 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  32.2 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  32.44 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  30.67 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  30.03 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>