162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3746 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  869    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  72.94 
 
 		 479 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  49.73 
 
 		 373 aa  335  9e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  46.77 
 
 		 363 aa  291  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  44.39 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  42.78 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  42.78 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  44.44 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  45.63 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  42.53 
 
 		 416 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  47.11 
 
 		 412 aa  272  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  46.7 
 
 		 418 aa  270  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  34.27 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  30.85 
 
 		 345 aa  160  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  29.23 
 
 		 343 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  30.63 
 
 		 358 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  34.18 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  29.89 
 
 		 359 aa  146  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  33.61 
 
 		 315 aa  146  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 844 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  29.7 
 
 		 343 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  29.09 
 
 		 347 aa  143  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  34.57 
 
 		 315 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  29.24 
 
 		 324 aa  136  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  31.92 
 
 		 316 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  29.6 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  32.35 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 810 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  29.75 
 
 		 312 aa  129  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  31.16 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  31.73 
 
 		 321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  29.51 
 
 		 479 aa  127  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  32.49 
 
 		 315 aa  126  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  29.79 
 
 		 481 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 777 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  30.66 
 
 		 316 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  30.18 
 
 		 438 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  30.54 
 
 		 791 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  29.92 
 
 		 438 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  26.77 
 
 		 498 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  30.18 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  27.55 
 
 		 791 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  28.18 
 
 		 479 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  29.18 
 
 		 484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  28.02 
 
 		 479 aa  117  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  27.09 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  30.19 
 
 		 312 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  29.81 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  31.23 
 
 		 319 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  31.23 
 
 		 319 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  30.38 
 
 		 313 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  26.49 
 
 		 483 aa  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  33.21 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  30.88 
 
 		 319 aa  106  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  28.74 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  27.89 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  28.74 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  28.35 
 
 		 304 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  26.29 
 
 		 305 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  28.35 
 
 		 303 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  27.34 
 
 		 285 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  32.18 
 
 		 315 aa  103  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  28.35 
 
 		 304 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  27.49 
 
 		 303 aa  103  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  27.95 
 
 		 304 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  26.97 
 
 		 285 aa  102  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  26.09 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  29.48 
 
 		 322 aa  100  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  27.56 
 
 		 304 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  30.48 
 
 		 303 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  33.1 
 
 		 305 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  26.82 
 
 		 318 aa  95.1  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  30.95 
 
 		 314 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  29.74 
 
 		 303 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  31.23 
 
 		 298 aa  94  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  27.06 
 
 		 360 aa  93.2  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  28.81 
 
 		 350 aa  92.8  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  28.73 
 
 		 304 aa  90.5  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  26.57 
 
 		 330 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  29.5 
 
 		 485 aa  90.1  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  28.85 
 
 		 314 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  28.57 
 
 		 301 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  29.73 
 
 		 303 aa  89.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  26.29 
 
 		 299 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  28.26 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  30.71 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  24.9 
 
 		 329 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  27.9 
 
 		 337 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  26.27 
 
 		 340 aa  82.8  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  30.35 
 
 		 314 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 791 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  27.21 
 
 		 310 aa  82.4  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  29.21 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  24.2 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  29.47 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  23.73 
 
 		 329 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  29.1 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  29.1 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  29.1 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  29.18 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>