174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6506 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  852    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  66.26 
 
 		 483 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  65.28 
 
 		 485 aa  553  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  66.26 
 
 		 479 aa  552  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  65.77 
 
 		 479 aa  553  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  65.77 
 
 		 479 aa  552  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  64.06 
 
 		 491 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  62.04 
 
 		 844 aa  537  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  63.57 
 
 		 481 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  61.35 
 
 		 791 aa  531  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 791 aa  529  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  62.29 
 
 		 791 aa  528  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  61.41 
 
 		 810 aa  528  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  61.41 
 
 		 777 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37952  predicted protein  39.35 
 
 		 775 aa  287  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  43.02 
 
 		 389 aa  260  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  40 
 
 		 343 aa  253  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  40.29 
 
 		 343 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  38.83 
 
 		 345 aa  251  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  39.56 
 
 		 359 aa  249  9e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  39.36 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  30.1 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  30.49 
 
 		 373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  30.27 
 
 		 318 aa  146  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  30.41 
 
 		 313 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  29.6 
 
 		 347 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  30.14 
 
 		 416 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  30.14 
 
 		 416 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  30.27 
 
 		 315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  30.77 
 
 		 454 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  30.14 
 
 		 416 aa  136  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  31.34 
 
 		 456 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  30.75 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  30.56 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  30.07 
 
 		 321 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  32.2 
 
 		 418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  28.54 
 
 		 320 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  27.36 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  27.45 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  27.21 
 
 		 438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  27.21 
 
 		 438 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  26.16 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  28.29 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  27.68 
 
 		 360 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  28.78 
 
 		 412 aa  113  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  31.46 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  28.88 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  31.25 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  26.47 
 
 		 484 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  28.71 
 
 		 363 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  26.39 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  28.64 
 
 		 315 aa  100  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  26.32 
 
 		 498 aa  96.3  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  28.92 
 
 		 318 aa  94.7  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  33.5 
 
 		 314 aa  94  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  29.28 
 
 		 314 aa  94  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  27.62 
 
 		 313 aa  93.2  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  35.35 
 
 		 381 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  24.81 
 
 		 300 aa  92.8  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  34.67 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  32.5 
 
 		 314 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  34.67 
 
 		 312 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  30.81 
 
 		 315 aa  87.8  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  25.24 
 
 		 329 aa  87  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  25.95 
 
 		 332 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  29.18 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  23.38 
 
 		 299 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  27.38 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  27.38 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  26.33 
 
 		 337 aa  82.8  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  27.22 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  29.52 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  27.9 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  32.18 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  25.78 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  31 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  29.47 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  28.3 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  27.71 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  26.11 
 
 		 329 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  30.2 
 
 		 303 aa  79.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  29.95 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  29.32 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  25.08 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  25.85 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  26.03 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  26.03 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  26.03 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  29.58 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  29.95 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  27.78 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  31.15 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  27.36 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  24.92 
 
 		 303 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  27.48 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  28.32 
 
 		 401 aa  76.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  34.6 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  27.11 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  25.48 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  25.47 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>