171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_37952 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_37952  predicted protein  100 
 
 		 775 aa  1602    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  40.39 
 
 		 479 aa  317  5e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  40.39 
 
 		 479 aa  317  6e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  39.19 
 
 		 479 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  39.31 
 
 		 481 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  38.18 
 
 		 491 aa  304  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  38.63 
 
 		 483 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  36.13 
 
 		 485 aa  303  9e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  36.58 
 
 		 791 aa  300  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 791 aa  298  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 777 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  36.25 
 
 		 791 aa  292  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  39.35 
 
 		 413 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 844 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  35.28 
 
 		 810 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  36.66 
 
 		 389 aa  213  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  31.4 
 
 		 345 aa  194  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  32.13 
 
 		 358 aa  187  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  30.79 
 
 		 359 aa  186  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  29.84 
 
 		 343 aa  178  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  29.49 
 
 		 343 aa  177  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  29.89 
 
 		 456 aa  134  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  32.64 
 
 		 454 aa  106  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  33.96 
 
 		 416 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  33.49 
 
 		 416 aa  101  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  33.49 
 
 		 416 aa  101  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  30.66 
 
 		 347 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  33.02 
 
 		 315 aa  97.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  33.33 
 
 		 418 aa  97.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  30.58 
 
 		 324 aa  95.9  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  32.2 
 
 		 379 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  31.43 
 
 		 318 aa  92.4  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  33.17 
 
 		 438 aa  91.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  33.17 
 
 		 438 aa  91.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  29.52 
 
 		 363 aa  90.1  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  32.69 
 
 		 321 aa  89  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  31.19 
 
 		 315 aa  88.2  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  28.78 
 
 		 373 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  33.18 
 
 		 319 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  32.72 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  31.73 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  32.72 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  30.09 
 
 		 314 aa  84  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  31.28 
 
 		 305 aa  83.2  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  28.91 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  30.81 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  36 
 
 		 314 aa  79.7  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  30.23 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  30.99 
 
 		 322 aa  77.4  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  30.41 
 
 		 313 aa  76.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  30.62 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2320  Acetamidase/Formamidase  27.27 
 
 		 429 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.167925  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  27.27 
 
 		 429 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  29.21 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2066  acetamidase/formamidase  27.27 
 
 		 429 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00155819  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  29.82 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2307  acetamidase/formamidase  27.27 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213262  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  30.92 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  29.35 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  36.36 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  27.01 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  32.39 
 
 		 328 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  28.24 
 
 		 303 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  29.8 
 
 		 303 aa  69.3  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  30 
 
 		 366 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  30 
 
 		 337 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  30 
 
 		 337 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  28.14 
 
 		 337 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  31.07 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  36.29 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  26.77 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  29.15 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  28.93 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  29.53 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  26.85 
 
 		 410 aa  67  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  26.3 
 
 		 410 aa  67  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  27.78 
 
 		 303 aa  66.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  27.65 
 
 		 332 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  28.95 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  28.44 
 
 		 315 aa  66.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  25.35 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  28.43 
 
 		 312 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  30.77 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  26.67 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  28.17 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  27.03 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  27.14 
 
 		 329 aa  63.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  26.89 
 
 		 409 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  27.17 
 
 		 414 aa  63.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  26.19 
 
 		 330 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  28.18 
 
 		 388 aa  62  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  26.67 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  25.93 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  27.04 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  27.78 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  25.49 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  28.5 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  28.65 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  27.33 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>