178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3274 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  98.75 
 
 		 319 aa  645    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  98.75 
 
 		 319 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 319 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  71.07 
 
 		 314 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  74.21 
 
 		 314 aa  461  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  71.7 
 
 		 314 aa  458  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  65.71 
 
 		 315 aa  415  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  47.02 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  45.34 
 
 		 318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  47.6 
 
 		 328 aa  268  8.999999999999999e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  46.69 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  46.37 
 
 		 312 aa  264  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  46.06 
 
 		 313 aa  263  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  34.9 
 
 		 393 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  33.97 
 
 		 388 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  35.05 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  35.45 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  32.48 
 
 		 330 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  34.01 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  33 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  33.67 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  33.22 
 
 		 439 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  39.5 
 
 		 484 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  33.22 
 
 		 339 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  33.87 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  30.98 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  36.98 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  36.79 
 
 		 315 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  31.7 
 
 		 336 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  35.27 
 
 		 337 aa  142  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  35.41 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  34.59 
 
 		 337 aa  139  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  31.21 
 
 		 304 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  31.21 
 
 		 304 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  31.99 
 
 		 304 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  34.33 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  30.87 
 
 		 303 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  31.65 
 
 		 304 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  34.07 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  32.78 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  28.48 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  31.31 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  32.51 
 
 		 358 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  32.35 
 
 		 329 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  34.01 
 
 		 332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  32.15 
 
 		 339 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  32.09 
 
 		 345 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  30.87 
 
 		 303 aa  135  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  35.81 
 
 		 321 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  31.79 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  33.56 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  33.56 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  33.56 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  29.83 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  31.75 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  32.54 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  35.37 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  31.51 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  30.69 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  30.69 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  34.71 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  32.53 
 
 		 337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  31.07 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  33.44 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  31.47 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  35.69 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  31.7 
 
 		 300 aa  129  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  31.19 
 
 		 328 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  30.3 
 
 		 304 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  33.55 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  34.46 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  38.43 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  38.06 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  31.9 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  30.47 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  33.01 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  30.73 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  30.75 
 
 		 343 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  30.77 
 
 		 416 aa  119  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  29.07 
 
 		 410 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  28.48 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  28.07 
 
 		 305 aa  116  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  27.95 
 
 		 401 aa  116  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  30.75 
 
 		 418 aa  115  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  30.13 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  30.24 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  29.07 
 
 		 418 aa  113  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  34.62 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  30.1 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  33.33 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  28.87 
 
 		 423 aa  112  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.117842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  34.27 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  34.27 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  34.23 
 
 		 412 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  30.03 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  29.53 
 
 		 491 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  30.71 
 
 		 411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  28.24 
 
 		 417 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  30.64 
 
 		 410 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  29.86 
 
 		 410 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>