178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0412 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  100 
 
 
301 aa  614  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  51.92 
 
 
299 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  50.87 
 
 
298 aa  301  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  50.7 
 
 
304 aa  297  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  50.17 
 
 
304 aa  297  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  50 
 
 
304 aa  295  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  50 
 
 
304 aa  295  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  49.65 
 
 
303 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  50.35 
 
 
304 aa  293  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  50 
 
 
304 aa  293  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  49.65 
 
 
303 aa  292  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  49.14 
 
 
304 aa  291  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  49.14 
 
 
304 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  48.96 
 
 
300 aa  276  4e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  43.09 
 
 
305 aa  273  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  48.04 
 
 
291 aa  271  1e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  46.71 
 
 
304 aa  266  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  39.52 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  39.18 
 
 
285 aa  212  7e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  39.86 
 
 
303 aa  205  6e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  38.83 
 
 
303 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  40.89 
 
 
305 aa  186  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  34.86 
 
 
329 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  33.1 
 
 
340 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  32.75 
 
 
330 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  31.76 
 
 
332 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  36.36 
 
 
311 aa  155  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  32.4 
 
 
314 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  35.45 
 
 
310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  30.54 
 
 
328 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  29.79 
 
 
329 aa  152  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  32.04 
 
 
329 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  32.75 
 
 
329 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  34.83 
 
 
350 aa  149  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.21645 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  34.78 
 
 
318 aa  149  5e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  33.11 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  32.08 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  31.82 
 
 
316 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  34.09 
 
 
314 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  32.34 
 
 
439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  32.78 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  33.9 
 
 
336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  31.8 
 
 
311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  33.33 
 
 
339 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  31.02 
 
 
313 aa  139  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  33.7 
 
 
315 aa  139  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  31.51 
 
 
319 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  34.6 
 
 
312 aa  135  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  31.19 
 
 
319 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  31.19 
 
 
319 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  36.05 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  31.83 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  33.22 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  30.64 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  30.64 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  30.36 
 
 
315 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  33.09 
 
 
315 aa  132  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  32.3 
 
 
316 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  32.18 
 
 
321 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  33.11 
 
 
332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  31.08 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  31.21 
 
 
318 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  31.93 
 
 
484 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  34.58 
 
 
303 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  31.31 
 
 
337 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  31.46 
 
 
339 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  31.42 
 
 
366 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  31.42 
 
 
337 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  31.42 
 
 
337 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  26.33 
 
 
498 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  29.49 
 
 
337 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  29.41 
 
 
342 aa  118  9e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  31.65 
 
 
347 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  28.83 
 
 
360 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  33.2 
 
 
363 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  30 
 
 
313 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  32.41 
 
 
388 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  30.41 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  30.67 
 
 
337 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  30.69 
 
 
429 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2066  acetamidase/formamidase  30.69 
 
 
429 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00155819  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2307  acetamidase/formamidase  30.69 
 
 
429 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213262  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2320  Acetamidase/Formamidase  30.32 
 
 
429 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.167925  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  30.57 
 
 
345 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  32.03 
 
 
381 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  29.8 
 
 
459 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  30.18 
 
 
373 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  28.2 
 
 
343 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  30.04 
 
 
358 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  30.23 
 
 
397 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  29.01 
 
 
343 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  32.14 
 
 
416 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  28.21 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  31.79 
 
 
416 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  31.79 
 
 
416 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  31.93 
 
 
393 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  25.76 
 
 
359 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  29.89 
 
 
401 aa  93.2  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  27.32 
 
 
409 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  27.32 
 
 
409 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>