179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21390 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  100 
 
 		 401 aa  822    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  52.19 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  50 
 
 		 416 aa  351  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  47.99 
 
 		 414 aa  347  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  47.47 
 
 		 417 aa  335  7e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  47.89 
 
 		 410 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  47.11 
 
 		 409 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  46.72 
 
 		 415 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  46.39 
 
 		 410 aa  329  6e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  47.22 
 
 		 417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  48.17 
 
 		 412 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  48.17 
 
 		 412 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  48.17 
 
 		 412 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  46.95 
 
 		 410 aa  325  8.000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  47.45 
 
 		 409 aa  322  8e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  47.48 
 
 		 409 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  47.48 
 
 		 409 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  48.81 
 
 		 408 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  47.63 
 
 		 410 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  45.96 
 
 		 418 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  47.09 
 
 		 409 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  47.87 
 
 		 409 aa  319  5e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  46.81 
 
 		 410 aa  319  7e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  46.56 
 
 		 410 aa  318  9e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  47.88 
 
 		 409 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  46.65 
 
 		 408 aa  316  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  46.09 
 
 		 411 aa  316  5e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  46.12 
 
 		 420 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  44.7 
 
 		 406 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  44.96 
 
 		 411 aa  312  5.999999999999999e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  45.54 
 
 		 423 aa  309  5e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.117842 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  44.67 
 
 		 418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  47.09 
 
 		 409 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  46.02 
 
 		 417 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  46.02 
 
 		 417 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  46.02 
 
 		 417 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  46.09 
 
 		 410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  46.3 
 
 		 410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  46.32 
 
 		 409 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  43.98 
 
 		 451 aa  302  6.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  46.58 
 
 		 409 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  43.15 
 
 		 426 aa  296  4e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0986635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  46.05 
 
 		 409 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  45.23 
 
 		 418 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  41.4 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  36.8 
 
 		 388 aa  193  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  32.53 
 
 		 459 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  31.32 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  32.7 
 
 		 322 aa  154  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2612  formamidase  43.1 
 
 		 206 aa  145  9e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0583639  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  33.05 
 
 		 328 aa  136  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  32.12 
 
 		 312 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  31.28 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  31.56 
 
 		 312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  29.52 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  29.49 
 
 		 314 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  28.22 
 
 		 319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  28.22 
 
 		 319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  27.95 
 
 		 319 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  30.41 
 
 		 314 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  31.23 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  29.89 
 
 		 301 aa  93.6  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  26.26 
 
 		 347 aa  93.2  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  28.06 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  29.8 
 
 		 484 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  26.04 
 
 		 324 aa  90.5  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  28.97 
 
 		 304 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  29.03 
 
 		 304 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  29.03 
 
 		 304 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  31.95 
 
 		 439 aa  87.8  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  30.77 
 
 		 313 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  28.82 
 
 		 315 aa  86.3  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  29.37 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  28.29 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  28.97 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  28.4 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  27.91 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  28.34 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  27.6 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  27.2 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  27.67 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  29.17 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  28.28 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  30.43 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  27.17 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  30.36 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  26.76 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  28.08 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  28.81 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  26.95 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  28.85 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  31.61 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  25.56 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  27.89 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  27.89 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  28.33 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  34.91 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  27.89 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  28.85 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  27.3 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>