172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1964 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  100 
 
 		 337 aa  684    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  63.1 
 
 		 366 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  63.1 
 
 		 337 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  63.1 
 
 		 337 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  62.2 
 
 		 337 aa  431  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  62.5 
 
 		 337 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  61.31 
 
 		 332 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  57.78 
 
 		 339 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  55.22 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  57.14 
 
 		 342 aa  363  2e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  53.03 
 
 		 336 aa  352  5.9999999999999994e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  49.55 
 
 		 350 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  39.12 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  42.35 
 
 		 329 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  41.23 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  40.78 
 
 		 329 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  40.72 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  38.96 
 
 		 329 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  42.62 
 
 		 340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  40.76 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  39.74 
 
 		 330 aa  205  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  37.27 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  36.45 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  36.68 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  36.4 
 
 		 303 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  37 
 
 		 439 aa  136  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  34.59 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  32.99 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  32.99 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  32.53 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  37.11 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  31.94 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  30.79 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  31.48 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  30.97 
 
 		 314 aa  126  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  33.45 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  35.14 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  32.53 
 
 		 318 aa  123  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  30.9 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  31.94 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  34.66 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  34.77 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  31.12 
 
 		 304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  31.25 
 
 		 347 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  27.45 
 
 		 358 aa  119  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  29.17 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  27.71 
 
 		 359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  29.83 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  30.39 
 
 		 304 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  34.88 
 
 		 320 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2320  Acetamidase/Formamidase  31.7 
 
 		 429 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.167925  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  30.71 
 
 		 343 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  29.82 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  29.82 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  28.67 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  31.7 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2066  acetamidase/formamidase  31.7 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00155819  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  34.23 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  29.68 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  28.82 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2307  acetamidase/formamidase  31.7 
 
 		 429 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213262  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  28.76 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  29.24 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  29.68 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  29.33 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  30.99 
 
 		 303 aa  112  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  30.67 
 
 		 301 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  32.8 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  30.36 
 
 		 343 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  33.07 
 
 		 484 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  27.65 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  29.79 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  30.98 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  30.69 
 
 		 305 aa  106  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  35.25 
 
 		 321 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  34.87 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  29.96 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  30.23 
 
 		 285 aa  104  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  29.45 
 
 		 312 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  30.23 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  30.12 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  29.28 
 
 		 485 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 791 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  28.35 
 
 		 791 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  27.97 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  28.39 
 
 		 491 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  31.71 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  28.31 
 
 		 483 aa  97.1  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 777 aa  96.3  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  27.72 
 
 		 373 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  31.12 
 
 		 393 aa  94.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  24.57 
 
 		 360 aa  93.2  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  30.86 
 
 		 438 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  27.03 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  31.54 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 810 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  26.85 
 
 		 479 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  30.86 
 
 		 438 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  30.86 
 
 		 379 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>