178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6677 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  100 
 
 		 314 aa  646    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  81.85 
 
 		 314 aa  544  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  71.07 
 
 		 319 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  71.07 
 
 		 319 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  71.07 
 
 		 319 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  68.15 
 
 		 314 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  62.42 
 
 		 315 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  46.82 
 
 		 328 aa  266  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  44.84 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  44.52 
 
 		 312 aa  255  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  43.23 
 
 		 313 aa  251  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  42.22 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  42.68 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  33.24 
 
 		 388 aa  172  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  36.92 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  35.47 
 
 		 439 aa  165  8e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  32.5 
 
 		 393 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  35.59 
 
 		 484 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  31.45 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  32.23 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  36.56 
 
 		 305 aa  148  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  32.23 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  32.24 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  31.39 
 
 		 459 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  35.64 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  33.44 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  31.62 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  35.45 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  33.56 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  30.95 
 
 		 359 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  32.08 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  31.21 
 
 		 358 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  31.4 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  30.82 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  30.82 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  31.51 
 
 		 304 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  30.48 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  30.82 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  31.48 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  30.14 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  31.06 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  29.72 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  34.46 
 
 		 336 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  30.48 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  34.26 
 
 		 337 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  30.16 
 
 		 329 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  30.3 
 
 		 329 aa  139  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  32.57 
 
 		 303 aa  139  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  30.48 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  34.36 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  34.36 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  34.36 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  33.91 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  30.49 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  30.97 
 
 		 343 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  33.9 
 
 		 339 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  38.98 
 
 		 313 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  32.54 
 
 		 332 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  32.58 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  34.34 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  31.82 
 
 		 343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  28.81 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  32.53 
 
 		 340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  31.94 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  35.32 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  33.33 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  30.64 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  30.1 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  32.88 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  36.13 
 
 		 321 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  31.53 
 
 		 350 aa  125  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  29.96 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  35.96 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  32.29 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  37.02 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  37.29 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  30.62 
 
 		 397 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  36.13 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  30.92 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  30.1 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  36.48 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  30.53 
 
 		 423 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.117842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  35.74 
 
 		 320 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  31.9 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  34.31 
 
 		 315 aa  115  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  30 
 
 		 411 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  33.87 
 
 		 438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  36.36 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  33.87 
 
 		 438 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  30.41 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  27.3 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  33.87 
 
 		 379 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  28.14 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  33.61 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  32.65 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  27.47 
 
 		 416 aa  109  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  29.4 
 
 		 410 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  28.85 
 
 		 408 aa  109  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 		 416 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 		 416 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>