174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0486 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  100 
 
 		 347 aa  709    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  40.67 
 
 		 318 aa  225  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  39.69 
 
 		 315 aa  225  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  37.81 
 
 		 312 aa  215  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  36.68 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  37.31 
 
 		 320 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  36.96 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  34.66 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  32.88 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  38.08 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  37.1 
 
 		 381 aa  192  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  34.8 
 
 		 321 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  36.31 
 
 		 484 aa  189  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  34.48 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  32.09 
 
 		 343 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  31.64 
 
 		 358 aa  186  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  33.96 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  32.49 
 
 		 345 aa  182  8.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  33.75 
 
 		 439 aa  179  5.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  32.39 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  34.92 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  32.91 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  34.02 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  32.04 
 
 		 479 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  31.8 
 
 		 479 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  31.8 
 
 		 479 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  31.68 
 
 		 454 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  32.73 
 
 		 438 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  32.43 
 
 		 438 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  29.07 
 
 		 481 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  32.43 
 
 		 379 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  35.34 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 777 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 810 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  29.95 
 
 		 456 aa  159  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  32.95 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  28.95 
 
 		 791 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  31.05 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  31.05 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  31.58 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  37.11 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  33.33 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  34.5 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  29.79 
 
 		 485 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 791 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  29.7 
 
 		 498 aa  149  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  30.51 
 
 		 791 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  35.8 
 
 		 305 aa  146  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  27.36 
 
 		 483 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  36.44 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  27.4 
 
 		 491 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 844 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  29.09 
 
 		 443 aa  143  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  33.6 
 
 		 315 aa  143  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  33.87 
 
 		 311 aa  142  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  37.2 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  35.41 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  35.41 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  35.41 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  29.72 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  33.64 
 
 		 318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  29.6 
 
 		 413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  29.61 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  30.26 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  29.28 
 
 		 312 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  29.88 
 
 		 366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  29.88 
 
 		 337 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  29.88 
 
 		 337 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  35.02 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  29.21 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  27.83 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  31.87 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  26.38 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  29.81 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  26.81 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  36.97 
 
 		 285 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  36.55 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  29.22 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  27.07 
 
 		 303 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  31.25 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  30.28 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  26.61 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2320  Acetamidase/Formamidase  26.58 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.167925  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  34.53 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  26.58 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2066  acetamidase/formamidase  26.58 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00155819  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  29.84 
 
 		 329 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  32.38 
 
 		 303 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  28.74 
 
 		 330 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  34.08 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  34.08 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2307  acetamidase/formamidase  26.58 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213262  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  29.88 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  32.38 
 
 		 303 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  33.63 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  33.19 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  31.33 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  24.68 
 
 		 303 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  33.63 
 
 		 304 aa  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  24.46 
 
 		 342 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>