175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4153 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  100 
 
 		 305 aa  599  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  39.74 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  39.29 
 
 		 328 aa  156  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  37.19 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  39.1 
 
 		 314 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  36.56 
 
 		 314 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  34.49 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  35.81 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  35.8 
 
 		 347 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  33.77 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  34.01 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  36.3 
 
 		 316 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  35.66 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  37.37 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  36.62 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  30.13 
 
 		 304 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  35.91 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  30.19 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  33.23 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  32.59 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  30.04 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  35.91 
 
 		 321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  29.47 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  29.47 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  30.39 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  29.47 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  35.29 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  35.29 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  29.17 
 
 		 304 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  28.99 
 
 		 303 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  33.58 
 
 		 324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  34.71 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  32.25 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  29.32 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  29.64 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  35.18 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  32.42 
 
 		 359 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  37.3 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  33.56 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  30.06 
 
 		 358 aa  125  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  29.57 
 
 		 311 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  32.65 
 
 		 340 aa  125  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  33.01 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  32.7 
 
 		 343 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  30.77 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  31.82 
 
 		 345 aa  122  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  34.37 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  29.81 
 
 		 429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  35.08 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2066  acetamidase/formamidase  29.81 
 
 		 429 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00155819  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2320  Acetamidase/Formamidase  29.49 
 
 		 429 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.167925  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2307  acetamidase/formamidase  29.81 
 
 		 429 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213262  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  30.72 
 
 		 329 aa  119  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  31.4 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  28.62 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  29.57 
 
 		 484 aa  115  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  29.77 
 
 		 328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  33.23 
 
 		 438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  32.57 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  29.9 
 
 		 310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  35.56 
 
 		 438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  35.19 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  26.87 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  30.23 
 
 		 329 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  30.9 
 
 		 329 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  33.58 
 
 		 373 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  36.4 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  32.8 
 
 		 336 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  30.59 
 
 		 329 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  28.28 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  31.56 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  27.58 
 
 		 498 aa  105  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  32.87 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  32.65 
 
 		 412 aa  105  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  33.12 
 
 		 339 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  33.45 
 
 		 303 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  30.9 
 
 		 416 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  30.56 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  30.56 
 
 		 416 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  30.56 
 
 		 416 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  32.12 
 
 		 456 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  30.72 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  27.54 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  33.1 
 
 		 443 aa  99  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  28.12 
 
 		 481 aa  99  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  28.84 
 
 		 791 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  30.4 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 844 aa  98.6  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  30.2 
 
 		 454 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  32.38 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 791 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 810 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  31.1 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  30.43 
 
 		 342 aa  95.9  7e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  27.02 
 
 		 479 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  27.02 
 
 		 479 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  34.04 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  31.56 
 
 		 418 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  27.64 
 
 		 479 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  27.48 
 
 		 360 aa  93.6  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>