174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5574 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  100 
 
 		 381 aa  764    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  54.2 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  54.9 
 
 		 363 aa  333  4e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  47.46 
 
 		 456 aa  309  6.999999999999999e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  51.52 
 
 		 412 aa  306  3e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  50.93 
 
 		 418 aa  299  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  45.39 
 
 		 454 aa  295  8e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  45.57 
 
 		 416 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  45.57 
 
 		 416 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  45.57 
 
 		 416 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  45.63 
 
 		 443 aa  280  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  45.38 
 
 		 479 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  37.1 
 
 		 347 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  37.61 
 
 		 316 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  39.26 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  37.32 
 
 		 320 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  36.47 
 
 		 315 aa  169  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  30.86 
 
 		 439 aa  166  5e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  36.86 
 
 		 318 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  32.61 
 
 		 345 aa  162  8.000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  34.6 
 
 		 313 aa  159  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  32.06 
 
 		 484 aa  159  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  32.17 
 
 		 324 aa  159  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  34.69 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  32.97 
 
 		 343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  33.24 
 
 		 359 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  34.14 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  31.79 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  34.2 
 
 		 316 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  32.76 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  30.98 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  30.62 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  30.98 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  32.85 
 
 		 321 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 810 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 777 aa  135  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  27.34 
 
 		 498 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  29.4 
 
 		 491 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 844 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  33.04 
 
 		 315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  28.73 
 
 		 360 aa  123  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  27.74 
 
 		 791 aa  122  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  37.7 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  36.22 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  28.52 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  31.74 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  36.54 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  33.73 
 
 		 322 aa  109  9.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  30.52 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  35.86 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  33.07 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  33.33 
 
 		 319 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  31.13 
 
 		 337 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 		 319 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  33.88 
 
 		 318 aa  106  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  33.33 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  31.37 
 
 		 303 aa  106  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  31.01 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  31.01 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  35.15 
 
 		 485 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  31.01 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  30.63 
 
 		 303 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  33.6 
 
 		 314 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  34.11 
 
 		 298 aa  105  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  31.52 
 
 		 312 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  29.96 
 
 		 337 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  33.5 
 
 		 483 aa  103  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  35.1 
 
 		 481 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  31.98 
 
 		 336 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  34.15 
 
 		 479 aa  103  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  27.67 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  34.98 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  32.82 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  33.17 
 
 		 479 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  31.13 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  32.03 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  29.84 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  31.8 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  34.16 
 
 		 791 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 791 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  29.96 
 
 		 332 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  30.65 
 
 		 339 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  35.35 
 
 		 413 aa  93.2  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  34.14 
 
 		 304 aa  93.2  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  27.49 
 
 		 330 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  28.73 
 
 		 342 aa  92.8  8e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  27.99 
 
 		 304 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  31.13 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  27.22 
 
 		 304 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  27.99 
 
 		 304 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  27.99 
 
 		 304 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  29.8 
 
 		 304 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  28.19 
 
 		 310 aa  90.5  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  27.61 
 
 		 303 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  29.25 
 
 		 291 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  27.79 
 
 		 329 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  29.39 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  27.61 
 
 		 303 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  31.06 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  30.49 
 
 		 304 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>