168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5147 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  100 
 
 		 337 aa  690    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  88.13 
 
 		 337 aa  618  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  85.16 
 
 		 366 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  85.16 
 
 		 337 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  85.16 
 
 		 337 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  64.16 
 
 		 332 aa  431  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  62.5 
 
 		 337 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  57.32 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  54.05 
 
 		 339 aa  368  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  55.16 
 
 		 342 aa  358  8e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  51.07 
 
 		 336 aa  345  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  48.66 
 
 		 350 aa  328  8e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  41.31 
 
 		 311 aa  242  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  41.67 
 
 		 329 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  40.46 
 
 		 329 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  41.5 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  40.89 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  39.4 
 
 		 329 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  40.89 
 
 		 332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  38.61 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  39.54 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  40.26 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  39.03 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  32.79 
 
 		 303 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  33.33 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  38.14 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  35.27 
 
 		 319 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  35.27 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  35.27 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  34.26 
 
 		 314 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  34.21 
 
 		 439 aa  133  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  29.21 
 
 		 347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  34.38 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  33.44 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  32.29 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  34.97 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  28.52 
 
 		 291 aa  125  8.000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  34.1 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  31.05 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2320  Acetamidase/Formamidase  32.52 
 
 		 429 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.167925  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  33.19 
 
 		 312 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  32.52 
 
 		 429 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2066  acetamidase/formamidase  32.52 
 
 		 429 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00155819  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  30.98 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  30.64 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2307  acetamidase/formamidase  32.52 
 
 		 429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  30.64 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  31.34 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  29.77 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  37.28 
 
 		 315 aa  119  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  31.54 
 
 		 358 aa  119  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  33.86 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  31.77 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  30.3 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  31.77 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  31.42 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  29.43 
 
 		 304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  31.41 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  29.49 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  31.08 
 
 		 318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  29.67 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  30.5 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  30.98 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  31.07 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  31 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  28.76 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  29.43 
 
 		 304 aa  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  31.16 
 
 		 313 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  29.35 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  29.93 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  30.74 
 
 		 343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  29.28 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  30.52 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  31.78 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  30.58 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  31.03 
 
 		 363 aa  106  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  29.35 
 
 		 484 aa  106  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  27.94 
 
 		 359 aa  106  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  31.8 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  31.15 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  29.82 
 
 		 373 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  30.56 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  30.56 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  30.56 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  30.82 
 
 		 304 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  26.51 
 
 		 388 aa  96.3  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 777 aa  96.3  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  27.76 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  27.13 
 
 		 491 aa  93.6  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  27.76 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  27.44 
 
 		 485 aa  92.4  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  26.28 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  28.03 
 
 		 456 aa  89.4  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  30.87 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  27.8 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  26.86 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  28.11 
 
 		 393 aa  87  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  27.73 
 
 		 454 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  25.32 
 
 		 459 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  28.66 
 
 		 418 aa  86.3  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>