177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23480 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  100 
 
 
300 aa  613  9.999999999999999e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  56.67 
 
 
298 aa  336  2.9999999999999997e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  49.65 
 
 
299 aa  293  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  48.96 
 
 
301 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  41.53 
 
 
304 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  41.33 
 
 
304 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  41.2 
 
 
304 aa  240  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  40.86 
 
 
304 aa  238  8e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  41.67 
 
 
304 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  41 
 
 
304 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  41 
 
 
304 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  41.33 
 
 
304 aa  235  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  40.53 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  41.58 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  40.53 
 
 
303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  38.1 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  41.32 
 
 
304 aa  206  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  35.11 
 
 
285 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  34.75 
 
 
285 aa  169  7e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  35.02 
 
 
303 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  36.33 
 
 
303 aa  154  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  32.66 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  33.44 
 
 
314 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  36.64 
 
 
305 aa  145  9e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  33.11 
 
 
311 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  31.68 
 
 
439 aa  140  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  31.54 
 
 
314 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  35.5 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  34.11 
 
 
312 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  32.01 
 
 
332 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  33.11 
 
 
329 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  30.61 
 
 
330 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  33.44 
 
 
310 aa  136  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  34.04 
 
 
340 aa  136  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  33.11 
 
 
312 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  33.76 
 
 
328 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  31.33 
 
 
339 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  30.03 
 
 
324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  29.25 
 
 
329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  30.77 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  30.74 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  32.63 
 
 
339 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  30.79 
 
 
337 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  31.7 
 
 
319 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  28.57 
 
 
329 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  31.19 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  31.94 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  30.72 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  30.72 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  30.72 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  32.34 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  32.44 
 
 
342 aa  127  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  32.12 
 
 
337 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  30.14 
 
 
313 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  29.59 
 
 
329 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  31.89 
 
 
343 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  31.76 
 
 
318 aa  123  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  32.11 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  34.25 
 
 
484 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  31.05 
 
 
332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  33 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  31.09 
 
 
345 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  30.19 
 
 
315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  31.27 
 
 
343 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  30.5 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  29.7 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  29.28 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  33.45 
 
 
303 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  30.8 
 
 
315 aa  112  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  30.43 
 
 
358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  26.99 
 
 
347 aa  108  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  29.74 
 
 
320 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  31.99 
 
 
303 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  30.43 
 
 
366 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  30.43 
 
 
337 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  30.43 
 
 
337 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  28.28 
 
 
305 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  33.68 
 
 
315 aa  105  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  24.39 
 
 
360 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  31.8 
 
 
321 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  32.22 
 
 
321 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  28.85 
 
 
379 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  29.18 
 
 
438 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  29.21 
 
 
316 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2066  acetamidase/formamidase  28.83 
 
 
429 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00155819  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  29.02 
 
 
429 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  28.85 
 
 
438 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  28.01 
 
 
393 aa  96.3  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  25 
 
 
485 aa  96.3  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2320  Acetamidase/Formamidase  29.02 
 
 
429 aa  95.9  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.167925  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  27.11 
 
 
373 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2307  acetamidase/formamidase  29.02 
 
 
429 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213262  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  29.57 
 
 
454 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  24.81 
 
 
413 aa  92.8  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  30 
 
 
363 aa  91.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  30.32 
 
 
416 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  24.93 
 
 
483 aa  90.5  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  29.96 
 
 
416 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  29.96 
 
 
416 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  25.15 
 
 
498 aa  88.6  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>