177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5754 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  100 
 
 		 328 aa  682    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  75.69 
 
 		 329 aa  536  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  74.15 
 
 		 340 aa  518  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  57.98 
 
 		 332 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  58.84 
 
 		 329 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  59.45 
 
 		 329 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  59.08 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  58.54 
 
 		 329 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  43.67 
 
 		 311 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  43.75 
 
 		 350 aa  236  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  44.04 
 
 		 336 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  41.58 
 
 		 339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  41.25 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  42.12 
 
 		 342 aa  220  3e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  41.83 
 
 		 339 aa  219  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  40.72 
 
 		 337 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  38.61 
 
 		 337 aa  211  9e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  37.95 
 
 		 337 aa  203  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  37.95 
 
 		 366 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  37.95 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  37.95 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  37.7 
 
 		 303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  37.05 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  34.58 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  34.68 
 
 		 304 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  33.56 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  33.56 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  33.56 
 
 		 304 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  33.22 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  32.88 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  33.54 
 
 		 311 aa  160  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  32.88 
 
 		 304 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  32.88 
 
 		 304 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  32.54 
 
 		 303 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  31.49 
 
 		 303 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  30.95 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  30.54 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  33 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  32.58 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  30.64 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  32.77 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  32.3 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  34.04 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  31.68 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  30.87 
 
 		 429 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  30.66 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2320  Acetamidase/Formamidase  30.87 
 
 		 429 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.167925  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2307  acetamidase/formamidase  30.87 
 
 		 429 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2066  acetamidase/formamidase  30.87 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00155819  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  30.74 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  31.53 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  31.53 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  31.19 
 
 		 319 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  32.89 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  30.1 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  30.98 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  30.43 
 
 		 328 aa  122  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  30.27 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  30.27 
 
 		 285 aa  122  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  31.31 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  29.14 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  32.67 
 
 		 320 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  31.91 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  30.47 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  30.79 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  29.63 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  29.77 
 
 		 305 aa  115  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  29.19 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  30.21 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  31.89 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  29.66 
 
 		 439 aa  113  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  27.91 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  26.05 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  28.39 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  27.3 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  27.87 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  27.54 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  26.39 
 
 		 413 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  29.49 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  25.54 
 
 		 343 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  25.14 
 
 		 359 aa  99.4  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  28.98 
 
 		 347 aa  99  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  26.26 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  29 
 
 		 438 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  29.32 
 
 		 438 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  27.74 
 
 		 363 aa  93.2  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  27.9 
 
 		 479 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  29.18 
 
 		 379 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  25.81 
 
 		 343 aa  92.8  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  27.27 
 
 		 315 aa  92.8  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  26.65 
 
 		 373 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  26.51 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  27.9 
 
 		 483 aa  91.3  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  27.19 
 
 		 791 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  27.24 
 
 		 479 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  27.24 
 
 		 479 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  27.19 
 
 		 491 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  25.88 
 
 		 485 aa  90.1  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  25 
 
 		 360 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 791 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>