176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1761 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  98.68 
 
 
379 aa  766    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  99.32 
 
 
438 aa  892    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  100 
 
 
438 aa  895    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  42.64 
 
 
439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  41.32 
 
 
484 aa  239  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  40.9 
 
 
324 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  39.69 
 
 
318 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  38.84 
 
 
315 aa  199  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  38.77 
 
 
313 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  37.42 
 
 
320 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  36.88 
 
 
315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  36.48 
 
 
316 aa  183  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  34.17 
 
 
358 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  35.94 
 
 
312 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  35.47 
 
 
360 aa  177  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  32.96 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  33.62 
 
 
343 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  33.99 
 
 
343 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  38.2 
 
 
321 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  37.58 
 
 
321 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  32.43 
 
 
347 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  32.29 
 
 
345 aa  161  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  36.34 
 
 
316 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  31.18 
 
 
498 aa  155  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  34.56 
 
 
315 aa  143  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  32.91 
 
 
313 aa  143  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  30.62 
 
 
381 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  35.31 
 
 
456 aa  140  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  36.61 
 
 
373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  32.35 
 
 
312 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  32.68 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  33.77 
 
 
454 aa  133  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 
791 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  33.84 
 
 
328 aa  130  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  34.22 
 
 
416 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  34.22 
 
 
416 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  30.34 
 
 
479 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  27.77 
 
 
483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  33.89 
 
 
416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  27.45 
 
 
791 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  32.1 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 
844 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  30.35 
 
 
322 aa  127  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  29.71 
 
 
479 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  29.47 
 
 
479 aa  126  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  34.59 
 
 
363 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  34.9 
 
 
418 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  35.11 
 
 
315 aa  124  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  32.26 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  26.93 
 
 
777 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  31.85 
 
 
285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  28.41 
 
 
481 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  30.45 
 
 
443 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  25.24 
 
 
791 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  27.21 
 
 
413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  32.71 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  32.95 
 
 
314 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47216 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  30.46 
 
 
318 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  35.56 
 
 
305 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  28.54 
 
 
810 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  26.52 
 
 
491 aa  113  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  28.98 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  33.7 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  32.59 
 
 
412 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  30.34 
 
 
339 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  32.33 
 
 
342 aa  104  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  30.18 
 
 
329 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  32.25 
 
 
336 aa  103  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  31.54 
 
 
339 aa  103  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  28.92 
 
 
319 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  31.08 
 
 
485 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  28.92 
 
 
319 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  32.32 
 
 
314 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  28.74 
 
 
311 aa  99.8  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  28.62 
 
 
319 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  29 
 
 
332 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  29.41 
 
 
459 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  28.85 
 
 
300 aa  96.7  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 
332 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  27.61 
 
 
303 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  28.17 
 
 
304 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2307  acetamidase/formamidase  31.06 
 
 
429 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  29.74 
 
 
329 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  28.16 
 
 
291 aa  95.1  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  29.11 
 
 
304 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  29 
 
 
330 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  31.75 
 
 
303 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  31.06 
 
 
429 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2320  Acetamidase/Formamidase  31.06 
 
 
429 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.167925  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  27.97 
 
 
303 aa  94.4  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  28.17 
 
 
304 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2066  acetamidase/formamidase  31.06 
 
 
429 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00155819  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  31.05 
 
 
303 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  31.82 
 
 
311 aa  94  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  29 
 
 
328 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  28.27 
 
 
304 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  28.69 
 
 
304 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  26.78 
 
 
304 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  27.11 
 
 
304 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  27.81 
 
 
397 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>