176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1548 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  100 
 
 		 439 aa  909    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  54.2 
 
 		 484 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  39.72 
 
 		 498 aa  318  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  42.64 
 
 		 438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  42.5 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  42.19 
 
 		 379 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  33.05 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  36.69 
 
 		 312 aa  183  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  36.51 
 
 		 324 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  33.7 
 
 		 373 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  33.75 
 
 		 347 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  35.92 
 
 		 316 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  34.92 
 
 		 318 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  35.76 
 
 		 320 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  35.6 
 
 		 321 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  35.06 
 
 		 321 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  36.57 
 
 		 315 aa  173  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  36.98 
 
 		 315 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  34.11 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  34.19 
 
 		 316 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  35.03 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  32.74 
 
 		 359 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  31.2 
 
 		 343 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  30.86 
 
 		 381 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  35.47 
 
 		 314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  34.81 
 
 		 314 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  33.78 
 
 		 312 aa  160  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  32.7 
 
 		 315 aa  160  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  32.14 
 
 		 345 aa  159  7e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  33.55 
 
 		 328 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  33.56 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  32.88 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  30.32 
 
 		 343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  33.55 
 
 		 319 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  33.55 
 
 		 319 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  32.88 
 
 		 315 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  33.22 
 
 		 319 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  31.76 
 
 		 314 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  36.77 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  34.01 
 
 		 305 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  30.75 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 777 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  33 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  31.68 
 
 		 300 aa  140  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  33.56 
 
 		 336 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  33.62 
 
 		 305 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  32.34 
 
 		 301 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  37 
 
 		 337 aa  136  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  32.65 
 
 		 318 aa  136  9e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  34.54 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  33.55 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  27.43 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  32.97 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  36.96 
 
 		 322 aa  134  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  34.21 
 
 		 337 aa  133  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  29.6 
 
 		 443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  28.18 
 
 		 454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  33.81 
 
 		 304 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  33.81 
 
 		 304 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  33.81 
 
 		 304 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  28.61 
 
 		 479 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  30.92 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  32.38 
 
 		 304 aa  130  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  33.45 
 
 		 303 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  32.89 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  29.3 
 
 		 418 aa  129  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  28.36 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  33.22 
 
 		 303 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  33.45 
 
 		 303 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  28.36 
 
 		 479 aa  127  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  32.74 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  30.05 
 
 		 481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  33.22 
 
 		 303 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  32.03 
 
 		 304 aa  127  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  32.97 
 
 		 304 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  33.97 
 
 		 366 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  33.97 
 
 		 337 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  33.97 
 
 		 337 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  29.89 
 
 		 412 aa  126  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  33.22 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  35.34 
 
 		 329 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  26.39 
 
 		 491 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  27.99 
 
 		 299 aa  124  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  32.61 
 
 		 304 aa  123  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  34.91 
 
 		 332 aa  123  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 791 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  27.1 
 
 		 416 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  27.1 
 
 		 416 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  27.1 
 
 		 416 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 		 429 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  32.3 
 
 		 285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  30.82 
 
 		 332 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2066  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 		 429 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00155819  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  26.59 
 
 		 483 aa  120  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  32.3 
 
 		 285 aa  120  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  31.71 
 
 		 329 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  35.06 
 
 		 329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2320  Acetamidase/Formamidase  33 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.167925  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 844 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2307  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>