177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1423 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  100 
 
 
340 aa  698    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  74.15 
 
 
328 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  70.73 
 
 
329 aa  489  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  56.84 
 
 
332 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  58.33 
 
 
330 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  56.44 
 
 
329 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  57.06 
 
 
329 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  55.83 
 
 
329 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  44.15 
 
 
311 aa  268  7e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  44.79 
 
 
350 aa  236  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  42.16 
 
 
339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  41.78 
 
 
342 aa  222  8e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  43.25 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  42.16 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  41.78 
 
 
339 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  42.62 
 
 
337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  39.54 
 
 
337 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  40.46 
 
 
337 aa  206  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  39.14 
 
 
366 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  39.14 
 
 
337 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  39.14 
 
 
337 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  35.59 
 
 
304 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  36.74 
 
 
303 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  35.25 
 
 
304 aa  178  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  34.92 
 
 
304 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  34.92 
 
 
303 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  34.3 
 
 
304 aa  176  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  35.23 
 
 
304 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  34.92 
 
 
304 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  34.92 
 
 
304 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  34.58 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  35.11 
 
 
311 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  34.24 
 
 
304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  37.95 
 
 
303 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  34.67 
 
 
303 aa  165  9e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  34.73 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  33.8 
 
 
291 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  33.1 
 
 
301 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  34.12 
 
 
305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  29.73 
 
 
305 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  35.86 
 
 
315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  31.16 
 
 
299 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2320  Acetamidase/Formamidase  31.69 
 
 
429 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.167925  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2307  acetamidase/formamidase  30.79 
 
 
429 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213262  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  31.69 
 
 
429 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2066  acetamidase/formamidase  31.69 
 
 
429 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00155819  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  34.67 
 
 
318 aa  140  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  32.34 
 
 
314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  34.28 
 
 
304 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  32.78 
 
 
319 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  34.04 
 
 
300 aa  136  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  32.45 
 
 
319 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  32.45 
 
 
319 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  32.38 
 
 
303 aa  134  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  32.53 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  30.32 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  32.54 
 
 
322 aa  129  7.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  33.44 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  32.65 
 
 
305 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  33.11 
 
 
328 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  32.24 
 
 
312 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  31.58 
 
 
343 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  30.69 
 
 
312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  29.73 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  29.73 
 
 
285 aa  119  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 
316 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  32.53 
 
 
320 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  30.69 
 
 
312 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  29.74 
 
 
313 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  30.65 
 
 
313 aa  116  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  31.49 
 
 
321 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  30.84 
 
 
321 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  32.28 
 
 
439 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  31.13 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  33.7 
 
 
438 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  33.7 
 
 
438 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  34.38 
 
 
379 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  30.03 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  29.28 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  30.8 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  30.26 
 
 
343 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  29.84 
 
 
345 aa  103  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  28.62 
 
 
358 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  28.69 
 
 
388 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  29.49 
 
 
363 aa  102  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  31.09 
 
 
315 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  28.48 
 
 
318 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  29.49 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  28.32 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  27.55 
 
 
373 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  26.3 
 
 
347 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  30.99 
 
 
484 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  28.39 
 
 
416 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  28.39 
 
 
416 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  29.02 
 
 
454 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  28.06 
 
 
416 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  29.38 
 
 
479 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  29.38 
 
 
479 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  28.27 
 
 
456 aa  92.8  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  31.84 
 
 
381 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>