171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2662 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  100 
 
 		 393 aa  788    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  49.36 
 
 		 388 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  45.58 
 
 		 459 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  42.2 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  37.97 
 
 		 418 aa  233  6e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  39.1 
 
 		 416 aa  229  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  39.8 
 
 		 415 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  39.69 
 
 		 397 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  38.62 
 
 		 410 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  36.1 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  38.13 
 
 		 414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  37.76 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  37.98 
 
 		 412 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  37.98 
 
 		 412 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  37.98 
 
 		 412 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  39.39 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  37.28 
 
 		 409 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  35.06 
 
 		 451 aa  207  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  36.41 
 
 		 410 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  36.48 
 
 		 410 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  37.85 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  34.69 
 
 		 318 aa  203  5e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  36.11 
 
 		 409 aa  202  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  37.53 
 
 		 409 aa  202  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  36.46 
 
 		 418 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  37.5 
 
 		 410 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  36.61 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  36.25 
 
 		 409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  35.48 
 
 		 411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  34.78 
 
 		 408 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  35.36 
 
 		 322 aa  197  3e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  35.95 
 
 		 418 aa  196  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  38.01 
 
 		 410 aa  196  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  35.41 
 
 		 417 aa  196  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  35.48 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  35.48 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  34.69 
 
 		 411 aa  193  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  35.71 
 
 		 410 aa  193  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  35 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  35.2 
 
 		 409 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  35.53 
 
 		 409 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  34.86 
 
 		 417 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  34.86 
 
 		 417 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  34.86 
 
 		 417 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  34.17 
 
 		 312 aa  187  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  36.06 
 
 		 409 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  33.89 
 
 		 312 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  35.79 
 
 		 409 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  35.79 
 
 		 409 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  32.47 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0986635 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  36.34 
 
 		 423 aa  178  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.117842 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  35.83 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  34.63 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  35.83 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  34.9 
 
 		 319 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  33.98 
 
 		 314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  32.58 
 
 		 408 aa  173  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  32.78 
 
 		 314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  36.09 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  32.42 
 
 		 315 aa  155  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  31.61 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  32.1 
 
 		 379 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  32.36 
 
 		 438 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  32.1 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2612  formamidase  37.79 
 
 		 206 aa  120  6e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0583639  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  30.87 
 
 		 324 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  30.86 
 
 		 312 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  28.71 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  29.88 
 
 		 313 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  30.97 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  30.52 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  30.38 
 
 		 340 aa  106  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  30.17 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  31.85 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  28.4 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  27.22 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  33.61 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  30.97 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  30.88 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  28.48 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  26.99 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  29.63 
 
 		 332 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  25.43 
 
 		 311 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  25.79 
 
 		 291 aa  99.8  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  27.19 
 
 		 304 aa  99.8  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  29.75 
 
 		 285 aa  99.8  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  31.36 
 
 		 439 aa  99  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  27.51 
 
 		 329 aa  99  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  30.09 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  33.74 
 
 		 337 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  27.63 
 
 		 304 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  27.63 
 
 		 304 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  28.18 
 
 		 304 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  29.07 
 
 		 330 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  27.63 
 
 		 304 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  27.96 
 
 		 483 aa  97.8  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  32.56 
 
 		 321 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  29.46 
 
 		 285 aa  97.4  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  28.46 
 
 		 485 aa  97.1  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>