175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3600 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  74.43 
 
 		 483 aa  760    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  68.09 
 
 		 479 aa  667    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  1001    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  67.59 
 
 		 479 aa  662    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  83.51 
 
 		 491 aa  858    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  68.72 
 
 		 479 aa  672    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  70.65 
 
 		 481 aa  665    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  64.72 
 
 		 791 aa  617  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  66.59 
 
 		 791 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  65.36 
 
 		 810 aa  604  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  59.15 
 
 		 844 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  65.61 
 
 		 791 aa  574  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 777 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  65.28 
 
 		 413 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37952  predicted protein  37.17 
 
 		 775 aa  301  1e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  42.51 
 
 		 389 aa  272  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  38.59 
 
 		 345 aa  266  8e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  39.13 
 
 		 343 aa  264  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  40.29 
 
 		 343 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  38.76 
 
 		 359 aa  256  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  38.44 
 
 		 358 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  29.5 
 
 		 373 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  31.55 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  32.69 
 
 		 418 aa  158  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  31.45 
 
 		 454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  30.17 
 
 		 318 aa  153  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  30.24 
 
 		 324 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  29.79 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  30.89 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  30.89 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  30.89 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  29.16 
 
 		 313 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  29.06 
 
 		 320 aa  141  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  28.88 
 
 		 316 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  27.98 
 
 		 321 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  26.83 
 
 		 312 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  28.36 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  27.9 
 
 		 363 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  27.49 
 
 		 321 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  34.23 
 
 		 315 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  28.36 
 
 		 412 aa  120  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  27.07 
 
 		 316 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  27.82 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  35.64 
 
 		 328 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  26.63 
 
 		 315 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  32.78 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  29.84 
 
 		 319 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  29.84 
 
 		 319 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  35.15 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  36.5 
 
 		 319 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  36.76 
 
 		 312 aa  103  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  27.44 
 
 		 314 aa  103  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  36.76 
 
 		 312 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  31.08 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  31.08 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  31.08 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  29.28 
 
 		 337 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  27.9 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  35.47 
 
 		 313 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  27.59 
 
 		 360 aa  100  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  34.01 
 
 		 314 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  31.38 
 
 		 314 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  25.92 
 
 		 303 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  29.32 
 
 		 337 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  23.99 
 
 		 318 aa  97.4  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  28.43 
 
 		 291 aa  97.8  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  33.33 
 
 		 329 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  27.78 
 
 		 332 aa  96.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  25 
 
 		 300 aa  96.3  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  32.32 
 
 		 329 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  31.47 
 
 		 330 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  31.13 
 
 		 329 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  26.34 
 
 		 303 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  28.75 
 
 		 336 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  26.4 
 
 		 479 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  29.19 
 
 		 303 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  27.44 
 
 		 337 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  31.38 
 
 		 305 aa  92  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  25.62 
 
 		 285 aa  92.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  33 
 
 		 298 aa  91.7  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  30.59 
 
 		 340 aa  91.7  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  24.84 
 
 		 339 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  28.1 
 
 		 393 aa  90.9  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  28.08 
 
 		 366 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  28.08 
 
 		 337 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  28.08 
 
 		 337 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  25.88 
 
 		 328 aa  90.1  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  29.5 
 
 		 443 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  30.26 
 
 		 329 aa  90.1  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  25.4 
 
 		 285 aa  90.1  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  28.71 
 
 		 332 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  23.64 
 
 		 305 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  25.18 
 
 		 498 aa  88.2  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  26.96 
 
 		 303 aa  88.2  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  25.16 
 
 		 310 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  25.23 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  30.48 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  29.76 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  25.31 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  23.82 
 
 		 311 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>