174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1337 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  98.08 
 
 		 312 aa  635    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  100 
 
 		 312 aa  645    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  86.86 
 
 		 313 aa  567  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  47.15 
 
 		 319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  47.15 
 
 		 319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  46.37 
 
 		 319 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  44.19 
 
 		 315 aa  264  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  45.6 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  44.52 
 
 		 314 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  43.55 
 
 		 314 aa  252  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  39.87 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  44.37 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  42.44 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  34.44 
 
 		 393 aa  185  9e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  38.25 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  39.55 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  33.78 
 
 		 439 aa  160  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  35.56 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  34.01 
 
 		 299 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  31.76 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  31.42 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  30.74 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  30.74 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  34.34 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  31.08 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  30.74 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  32.62 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  29.56 
 
 		 388 aa  145  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  31.79 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  31.42 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  36.07 
 
 		 315 aa  145  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  42.25 
 
 		 484 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  32.26 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  30.41 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  29.87 
 
 		 459 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  34.19 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  31.34 
 
 		 285 aa  139  6e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  34.11 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  31.03 
 
 		 360 aa  138  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  34.41 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  29.61 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  30.34 
 
 		 420 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  32.35 
 
 		 438 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  30.99 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  33.23 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  32.35 
 
 		 438 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  33.22 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  29.81 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  31.33 
 
 		 379 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  34.11 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  35.45 
 
 		 315 aa  136  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  31.17 
 
 		 330 aa  136  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  30.14 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  31.03 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  38.08 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  34.24 
 
 		 321 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  32.48 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  30.64 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  29.14 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  32.41 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  31.56 
 
 		 401 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  31.78 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  29.59 
 
 		 397 aa  129  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  33.56 
 
 		 321 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  30.33 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  30.18 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  33.81 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  30.2 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  30.2 
 
 		 329 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  29.69 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  30.17 
 
 		 373 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  30.69 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  30.99 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  31.6 
 
 		 305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  30.07 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  27.7 
 
 		 410 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  32.99 
 
 		 416 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  32.99 
 
 		 416 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  32.99 
 
 		 416 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  32.39 
 
 		 454 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  30.84 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  30.26 
 
 		 337 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  29.44 
 
 		 414 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  33.58 
 
 		 418 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  28.47 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  29.95 
 
 		 479 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  31.49 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  28.83 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  30.63 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  30.19 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  26.87 
 
 		 481 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  27.73 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  27.32 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  29.28 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  29.28 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  29.28 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  36.57 
 
 		 479 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  28.85 
 
 		 332 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  36.57 
 
 		 479 aa  109  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  29.81 
 
 		 342 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>