178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0465 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0465  formamidase  100 
 
 
322 aa  649    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  77.1 
 
 
318 aa  493  9.999999999999999e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  47.02 
 
 
319 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  47.02 
 
 
319 aa  288  7e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  47.02 
 
 
319 aa  288  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  43.79 
 
 
328 aa  273  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  43.31 
 
 
314 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  41.72 
 
 
315 aa  258  7e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  43.49 
 
 
314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  42.22 
 
 
314 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  39.87 
 
 
312 aa  250  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  40.19 
 
 
312 aa  249  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  39.87 
 
 
313 aa  246  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  35.36 
 
 
393 aa  196  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  34.48 
 
 
388 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  34.91 
 
 
397 aa  176  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  32.55 
 
 
414 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  33.94 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  37.77 
 
 
315 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  33.78 
 
 
459 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  30.57 
 
 
417 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  32.89 
 
 
410 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  37.11 
 
 
347 aa  156  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  35.64 
 
 
318 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  32.45 
 
 
406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  32.7 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  30.65 
 
 
408 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  30.23 
 
 
418 aa  152  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  29.55 
 
 
418 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  35.44 
 
 
312 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  30.26 
 
 
417 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  30.26 
 
 
417 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  30.26 
 
 
417 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  33.33 
 
 
410 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  34.49 
 
 
305 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  31.1 
 
 
411 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  32.53 
 
 
358 aa  145  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  31.48 
 
 
410 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  32.72 
 
 
410 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  32.2 
 
 
409 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  30.53 
 
 
415 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  32.2 
 
 
418 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  33.86 
 
 
313 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  34.38 
 
 
320 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  32.34 
 
 
359 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  31.59 
 
 
416 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  32.25 
 
 
301 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  29.08 
 
 
343 aa  142  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  30.87 
 
 
412 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  30.87 
 
 
412 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  30.87 
 
 
412 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  32.53 
 
 
409 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  31.58 
 
 
410 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  30.61 
 
 
410 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  33.11 
 
 
303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  29.58 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  30.87 
 
 
409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  30.87 
 
 
409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  30.87 
 
 
409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  28.36 
 
 
451 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  31.47 
 
 
409 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 
285 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  35.22 
 
 
316 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  32.54 
 
 
345 aa  139  7.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  35.45 
 
 
315 aa  139  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  32.37 
 
 
329 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  30.37 
 
 
409 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  35.12 
 
 
304 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  35.12 
 
 
304 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  35.12 
 
 
304 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  29.17 
 
 
343 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  33.01 
 
 
285 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  31.41 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  31.83 
 
 
330 aa  136  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  33.78 
 
 
303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  30.08 
 
 
423 aa  135  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.117842 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  34.11 
 
 
304 aa  135  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  30.03 
 
 
409 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  30.57 
 
 
411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  29.38 
 
 
420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  33.78 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  31.77 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  36.96 
 
 
439 aa  134  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  33.11 
 
 
304 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  33.44 
 
 
304 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  34.78 
 
 
303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  31.72 
 
 
332 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  32.57 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  30.33 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  33.44 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  29.43 
 
 
426 aa  130  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0986635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  35.96 
 
 
484 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  30.9 
 
 
316 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  31.83 
 
 
409 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  30.33 
 
 
321 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  32.54 
 
 
340 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  31.99 
 
 
329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  30.64 
 
 
438 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  31.6 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  32.33 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0100916 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>