168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1186 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  100 
 
 
337 aa  684    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  88.72 
 
 
366 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  88.13 
 
 
337 aa  618  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  88.72 
 
 
337 aa  616  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  88.72 
 
 
337 aa  616  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  62.2 
 
 
337 aa  431  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  63.86 
 
 
332 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  57.01 
 
 
339 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  52.55 
 
 
339 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  55.16 
 
 
342 aa  360  1e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  50.76 
 
 
336 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  49.24 
 
 
350 aa  329  4e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  41.21 
 
 
311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  40.71 
 
 
329 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  38.82 
 
 
329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  41.25 
 
 
330 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  40.07 
 
 
329 aa  216  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  40.69 
 
 
332 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  40.13 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  40.46 
 
 
340 aa  206  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  37.95 
 
 
328 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  39.22 
 
 
310 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  39.48 
 
 
311 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  33.88 
 
 
303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  33.77 
 
 
303 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  38.19 
 
 
315 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  35.64 
 
 
314 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  34.59 
 
 
319 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  34.25 
 
 
319 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  34.25 
 
 
319 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  34.54 
 
 
439 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  33.22 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  32.44 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  32.57 
 
 
322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  32.56 
 
 
304 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  29.9 
 
 
291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  32.89 
 
 
304 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  27.83 
 
 
347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  34.03 
 
 
314 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  32.56 
 
 
304 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  32.23 
 
 
304 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  32.23 
 
 
303 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  30.86 
 
 
358 aa  125  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  32.12 
 
 
300 aa  125  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  33.69 
 
 
304 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  33.69 
 
 
304 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  32.53 
 
 
312 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  31.44 
 
 
304 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  32.86 
 
 
303 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  35.97 
 
 
316 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  35.58 
 
 
315 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  35.57 
 
 
320 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2320  Acetamidase/Formamidase  32.75 
 
 
429 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.167925  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  31.31 
 
 
301 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  38.14 
 
 
315 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  32.59 
 
 
316 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  32.75 
 
 
429 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2066  acetamidase/formamidase  32.75 
 
 
429 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00155819  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  30.9 
 
 
318 aa  122  9e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  34.04 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2307  acetamidase/formamidase  32.75 
 
 
429 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213262  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  32.3 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  29.43 
 
 
305 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  30.92 
 
 
312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  36.61 
 
 
313 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  31.85 
 
 
313 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  32.35 
 
 
343 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  31.48 
 
 
303 aa  116  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  30.26 
 
 
312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  29.08 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  29.49 
 
 
303 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  30 
 
 
484 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  30.74 
 
 
305 aa  109  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  31.41 
 
 
363 aa  108  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  32.63 
 
 
324 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  31.62 
 
 
343 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  32.31 
 
 
381 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  31.78 
 
 
359 aa  106  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  30.55 
 
 
321 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  30.87 
 
 
321 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  26.77 
 
 
388 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  27.95 
 
 
298 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  29.02 
 
 
373 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  31.85 
 
 
304 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  30.4 
 
 
305 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  29.25 
 
 
491 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  29.32 
 
 
485 aa  98.2  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  28.52 
 
 
285 aa  97.4  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  29.97 
 
 
416 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  29.97 
 
 
416 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  29.97 
 
 
416 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  28.37 
 
 
299 aa  97.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  28.52 
 
 
285 aa  97.1  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 
777 aa  93.6  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  25.45 
 
 
459 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  30.86 
 
 
315 aa  89.4  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  28.44 
 
 
479 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  27.04 
 
 
479 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  28.1 
 
 
393 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  26.5 
 
 
360 aa  86.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>