More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6507 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 777 aa  1578    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  50.51 
 
 		 791 aa  763    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  49.24 
 
 		 791 aa  743    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 810 aa  708    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 844 aa  708    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  50.44 
 
 		 791 aa  768    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  62.5 
 
 		 481 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  62.41 
 
 		 479 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  62.18 
 
 		 479 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  62.18 
 
 		 479 aa  561  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  62.56 
 
 		 483 aa  556  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  58.33 
 
 		 485 aa  558  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  60.05 
 
 		 491 aa  552  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  61.41 
 
 		 413 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37952  predicted protein  37.9 
 
 		 775 aa  291  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  38.66 
 
 		 345 aa  261  5.0000000000000005e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  38.41 
 
 		 359 aa  255  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  39.61 
 
 		 358 aa  255  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  41.29 
 
 		 389 aa  251  4e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  39.18 
 
 		 343 aa  251  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  38.89 
 
 		 343 aa  250  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  32.13 
 
 		 324 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  30.23 
 
 		 347 aa  160  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  30.89 
 
 		 456 aa  159  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  31.57 
 
 		 318 aa  156  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  31.65 
 
 		 373 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 316 aa  154  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  29.13 
 
 		 416 aa  154  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  31.63 
 
 		 313 aa  153  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  31.18 
 
 		 454 aa  153  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  28.91 
 
 		 416 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  28.91 
 
 		 416 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  31.46 
 
 		 315 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  30.1 
 
 		 312 aa  144  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  30.53 
 
 		 439 aa  140  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  30.1 
 
 		 320 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  34.14 
 
 		 418 aa  137  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  29.81 
 
 		 381 aa  135  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  29.19 
 
 		 316 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  29.64 
 
 		 315 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  32.72 
 
 		 328 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  30.56 
 
 		 321 aa  125  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  29.21 
 
 		 443 aa  124  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  29.64 
 
 		 484 aa  124  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  27.17 
 
 		 379 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  31.84 
 
 		 330 aa  122  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  30.07 
 
 		 321 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  26.93 
 
 		 438 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  26.93 
 
 		 438 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  29.1 
 
 		 316 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  30.96 
 
 		 363 aa  120  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 324 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 329 aa  117  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 346 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 346 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 346 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  27.36 
 
 		 320 aa  114  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  29.68 
 
 		 322 aa  114  8.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 347 aa  114  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 352 aa  114  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  29.24 
 
 		 315 aa  113  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 318 aa  110  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 335 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  27.42 
 
 		 321 aa  107  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  27.48 
 
 		 324 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 339 aa  105  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  30.15 
 
 		 412 aa  105  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  29.57 
 
 		 318 aa  105  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  28.4 
 
 		 315 aa  105  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  27.11 
 
 		 303 aa  105  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 319 aa  105  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  27.18 
 
 		 303 aa  103  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  29.72 
 
 		 318 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 318 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  35.05 
 
 		 303 aa  102  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 317 aa  101  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 317 aa  100  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  29.41 
 
 		 332 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  34.31 
 
 		 312 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  27.81 
 
 		 329 aa  99.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  34.31 
 
 		 312 aa  99.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 333 aa  99  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  27.46 
 
 		 340 aa  98.6  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  36.36 
 
 		 291 aa  98.2  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  36.27 
 
 		 313 aa  97.8  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 327 aa  97.8  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  28.53 
 
 		 479 aa  97.4  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  26.63 
 
 		 329 aa  97.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  47.96 
 
 		 314 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 368 aa  97.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  27.16 
 
 		 337 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 367 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  36 
 
 		 298 aa  96.3  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  28.4 
 
 		 337 aa  96.3  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 318 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  27.67 
 
 		 329 aa  95.5  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  26.99 
 
 		 360 aa  94.7  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  25.47 
 
 		 498 aa  94.7  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  35.86 
 
 		 304 aa  94.4  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 318 aa  94  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>