170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17320 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  100 
 
 
412 aa  795    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  60.06 
 
 
363 aa  371  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  52.34 
 
 
381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  51.37 
 
 
373 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  50.38 
 
 
418 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  46.1 
 
 
456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  46.31 
 
 
416 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  46.31 
 
 
416 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  46.56 
 
 
416 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  47.11 
 
 
443 aa  275  9e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  43.57 
 
 
454 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  46.24 
 
 
479 aa  229  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  33.33 
 
 
347 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  38.31 
 
 
318 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  32.98 
 
 
358 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  33.24 
 
 
345 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  36.31 
 
 
316 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  31.88 
 
 
343 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  35.03 
 
 
313 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  34.25 
 
 
315 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  33.8 
 
 
359 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  34.05 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  31.84 
 
 
343 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  29.71 
 
 
479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  30.34 
 
 
439 aa  127  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  34.99 
 
 
315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  31.49 
 
 
312 aa  126  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  31.83 
 
 
484 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  34.93 
 
 
316 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  32.01 
 
 
324 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  36.92 
 
 
319 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  30.71 
 
 
481 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  28.5 
 
 
485 aa  123  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  36.54 
 
 
319 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  36.54 
 
 
319 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  37.89 
 
 
314 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  29.68 
 
 
491 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 
844 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  32.39 
 
 
321 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  32.11 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  32.21 
 
 
318 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  34.47 
 
 
312 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  37.89 
 
 
315 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  28.78 
 
 
413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  29.11 
 
 
360 aa  116  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  28.29 
 
 
483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  34.1 
 
 
322 aa  114  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  33.71 
 
 
312 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  34.5 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  31.62 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  35.02 
 
 
438 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  31.57 
 
 
810 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  35.02 
 
 
438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  35.02 
 
 
379 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  36.5 
 
 
328 aa  110  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  36.82 
 
 
314 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
777 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  36.68 
 
 
479 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  36.68 
 
 
479 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  32.65 
 
 
305 aa  106  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  36.58 
 
 
314 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  27.21 
 
 
291 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 
791 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 
791 aa  99.8  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  26.01 
 
 
305 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  28.64 
 
 
791 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  32.08 
 
 
303 aa  97.1  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  28.01 
 
 
498 aa  94.7  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  30.39 
 
 
388 aa  93.2  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  31.66 
 
 
304 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  28.35 
 
 
340 aa  92.8  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  30.5 
 
 
304 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  30.5 
 
 
304 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  30.5 
 
 
304 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  34.56 
 
 
304 aa  90.5  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  27.74 
 
 
311 aa  90.1  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  28.32 
 
 
329 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  30.5 
 
 
303 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  30.5 
 
 
303 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  29.73 
 
 
304 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  29.34 
 
 
304 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  27.87 
 
 
401 aa  87.8  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  29.34 
 
 
304 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  29.83 
 
 
410 aa  87  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  29.39 
 
 
411 aa  87  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  28.09 
 
 
410 aa  86.7  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  30.32 
 
 
337 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  29.56 
 
 
332 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  27.6 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  27.94 
 
 
410 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  29.39 
 
 
303 aa  86.3  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  27.78 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  29.52 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  29.52 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  29.52 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  29.36 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  29 
 
 
412 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  31.73 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  27.27 
 
 
409 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  28.01 
 
 
409 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>