More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3229 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
346 aa  719    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
346 aa  719    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
346 aa  719    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  83.43 
 
 
352 aa  584  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  83.14 
 
 
347 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  35.62 
 
 
330 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 
318 aa  189  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  35.22 
 
 
324 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 
327 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 
318 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  30.94 
 
 
320 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  30.39 
 
 
321 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
319 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 
325 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  29.31 
 
 
319 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 
319 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  29.31 
 
 
319 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  29.31 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  30.11 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  27.72 
 
 
791 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 
791 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  26.33 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  28.57 
 
 
311 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 
324 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  27.94 
 
 
340 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  26.56 
 
 
791 aa  122  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 
330 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
337 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  24.22 
 
 
321 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  25.91 
 
 
335 aa  119  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  24.3 
 
 
321 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  25.63 
 
 
339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  25.79 
 
 
336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 
389 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 
319 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  30.85 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 
777 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  24.35 
 
 
326 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  24.92 
 
 
333 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 
318 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4563  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.409707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  27.39 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  26.45 
 
 
315 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  25.48 
 
 
330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3050  transcriptional regulator, AraC family  23.79 
 
 
323 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  27.46 
 
 
305 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 
328 aa  109  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4450  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 
314 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  0.0834018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.91 
 
 
342 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.25 
 
 
385 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 
327 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
844 aa  106  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  28.38 
 
 
317 aa  106  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  26.71 
 
 
318 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.88 
 
 
304 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  23.99 
 
 
316 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 
318 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  27.59 
 
 
348 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 
322 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.92 
 
 
316 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0534  transcriptional regulator, AraC family  32.13 
 
 
261 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
342 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.05 
 
 
299 aa  99.4  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 
344 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  25.99 
 
 
382 aa  96.7  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2723  helix-turn-helix domain-containing protein  27.06 
 
 
313 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  25.86 
 
 
301 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.76 
 
 
314 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  25.86 
 
 
301 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1928  AraC family transcriptional regulator  25.57 
 
 
325 aa  95.9  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0979151  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.86 
 
 
301 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  25.66 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.66 
 
 
301 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  25.58 
 
 
309 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.66 
 
 
301 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.5 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.06 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3156  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 
368 aa  92.4  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  23.58 
 
 
319 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  23.73 
 
 
317 aa  92  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  25.96 
 
 
331 aa  90.9  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4875  AraC family transcriptional regulator  23.64 
 
 
319 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0955854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6715  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 
298 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  25.57 
 
 
367 aa  89.7  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 
312 aa  89.4  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1695  transcriptional regulator, AraC family  22.94 
 
 
324 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4500  AraC family transcriptional regulator  26.37 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>