More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4963 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  50.8 
 
 		 791 aa  768    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 810 aa  1647    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 777 aa  730    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  50.43 
 
 		 791 aa  771    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  62.03 
 
 		 844 aa  987    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  50.19 
 
 		 791 aa  757    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  65.36 
 
 		 485 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  61.72 
 
 		 491 aa  595  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  63.11 
 
 		 483 aa  567  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  62.53 
 
 		 479 aa  547  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  63.61 
 
 		 481 aa  548  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  62.29 
 
 		 479 aa  544  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  62.29 
 
 		 479 aa  542  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  61.41 
 
 		 413 aa  529  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37952  predicted protein  35.28 
 
 		 775 aa  272  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  42.01 
 
 		 389 aa  266  8e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  37.5 
 
 		 345 aa  254  6e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  38.78 
 
 		 359 aa  244  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  37.08 
 
 		 343 aa  243  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  37.26 
 
 		 343 aa  235  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  38.16 
 
 		 358 aa  233  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 316 aa  161  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  30.4 
 
 		 347 aa  160  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  29.78 
 
 		 324 aa  153  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  33.73 
 
 		 456 aa  152  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  34.18 
 
 		 416 aa  151  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  34.18 
 
 		 416 aa  151  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  33.96 
 
 		 454 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  32.13 
 
 		 318 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  33.72 
 
 		 416 aa  148  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  30.7 
 
 		 320 aa  147  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  30.32 
 
 		 373 aa  146  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  30.84 
 
 		 313 aa  144  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  30.66 
 
 		 381 aa  137  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  28.88 
 
 		 312 aa  135  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  30.12 
 
 		 316 aa  134  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  30.75 
 
 		 315 aa  131  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  30.26 
 
 		 443 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  31.9 
 
 		 418 aa  128  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  30.34 
 
 		 315 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 329 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  29.47 
 
 		 321 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  29.44 
 
 		 321 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  28.82 
 
 		 322 aa  116  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  28.78 
 
 		 438 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  28.64 
 
 		 379 aa  115  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  28.54 
 
 		 438 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  29.13 
 
 		 316 aa  114  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  31.03 
 
 		 363 aa  114  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  31.5 
 
 		 412 aa  108  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  25.97 
 
 		 439 aa  108  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  35 
 
 		 315 aa  108  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  33.71 
 
 		 314 aa  107  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  35.15 
 
 		 328 aa  106  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  25.94 
 
 		 318 aa  102  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  35.68 
 
 		 314 aa  101  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  28.18 
 
 		 319 aa  100  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  28.96 
 
 		 330 aa  100  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  28.18 
 
 		 319 aa  100  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  36 
 
 		 319 aa  100  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  32.75 
 
 		 320 aa  99.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  26.28 
 
 		 315 aa  98.2  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  30.37 
 
 		 479 aa  97.8  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 346 aa  96.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  33.51 
 
 		 305 aa  97.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 346 aa  96.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 346 aa  96.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  33.5 
 
 		 313 aa  97.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 324 aa  97.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  28 
 
 		 314 aa  95.9  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  33.83 
 
 		 312 aa  95.1  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  33.83 
 
 		 312 aa  94.4  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 368 aa  94  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 352 aa  92.8  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  26.99 
 
 		 337 aa  91.7  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 324 aa  91.7  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 321 aa  90.5  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 319 aa  90.5  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  31.66 
 
 		 329 aa  90.5  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 321 aa  90.5  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 389 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  26.8 
 
 		 360 aa  90.1  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  27.36 
 
 		 366 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  31.16 
 
 		 329 aa  89  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 326 aa  89  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 327 aa  89  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 347 aa  89  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 317 aa  88.6  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  27.36 
 
 		 337 aa  88.6  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  27.36 
 
 		 337 aa  88.6  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 335 aa  88.6  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 318 aa  87.8  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  27.75 
 
 		 393 aa  87.4  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  30.15 
 
 		 329 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 305 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 326 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  34.66 
 
 		 348 aa  87  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  27.64 
 
 		 337 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  30.24 
 
 		 330 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  28.93 
 
 		 337 aa  86.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>