168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2015 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  77.03 
 
 		 416 aa  655    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  77.03 
 
 		 416 aa  655    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  76.56 
 
 		 416 aa  651    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  100 
 
 		 454 aa  907    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  74.94 
 
 		 456 aa  639    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  52.94 
 
 		 418 aa  360  3e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  48.4 
 
 		 373 aa  311  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  45.39 
 
 		 381 aa  296  7e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  44.39 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  47.09 
 
 		 363 aa  288  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  43.12 
 
 		 412 aa  264  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  42.32 
 
 		 479 aa  233  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  31.68 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  31.35 
 
 		 345 aa  162  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  31.72 
 
 		 485 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  31.75 
 
 		 491 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  31.7 
 
 		 359 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 844 aa  156  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 777 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 791 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  32.39 
 
 		 481 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 810 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  30.68 
 
 		 479 aa  149  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  30.81 
 
 		 479 aa  149  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  30.91 
 
 		 479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  29.25 
 
 		 483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 791 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  31.11 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  30.05 
 
 		 343 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  29.06 
 
 		 324 aa  143  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  32.01 
 
 		 343 aa  143  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  32.01 
 
 		 315 aa  142  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  29.36 
 
 		 791 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  30.77 
 
 		 413 aa  136  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  34.11 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  30.71 
 
 		 313 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  33.77 
 
 		 438 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  33.77 
 
 		 438 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  30.69 
 
 		 316 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  28.93 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  30.47 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  31.56 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  30.93 
 
 		 315 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  29.13 
 
 		 312 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  29.92 
 
 		 316 aa  123  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  32.75 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  29.06 
 
 		 315 aa  119  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  32.99 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  32.39 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  28.49 
 
 		 321 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  28.23 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  26.33 
 
 		 484 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  32.64 
 
 		 303 aa  113  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  32.76 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  28.75 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  31.49 
 
 		 303 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  31.23 
 
 		 314 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  25.85 
 
 		 498 aa  106  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  31.1 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37952  predicted protein  32.64 
 
 		 775 aa  106  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  32.08 
 
 		 314 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  31.27 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  31.27 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  31.27 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  30.94 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  30.82 
 
 		 314 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  29.71 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  29.15 
 
 		 285 aa  100  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  28.84 
 
 		 285 aa  98.6  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  27.99 
 
 		 318 aa  97.8  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  28.83 
 
 		 304 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  30.2 
 
 		 305 aa  97.4  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  27.37 
 
 		 304 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  27.37 
 
 		 304 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  27.74 
 
 		 304 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  27.01 
 
 		 304 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  30 
 
 		 393 aa  94.4  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  29.02 
 
 		 340 aa  94  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  27.01 
 
 		 303 aa  93.6  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  29.57 
 
 		 300 aa  93.6  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  28.1 
 
 		 304 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  28.47 
 
 		 303 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  27.68 
 
 		 304 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  31.66 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  26.28 
 
 		 304 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  24.83 
 
 		 305 aa  91.3  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  26.56 
 
 		 330 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  26.83 
 
 		 291 aa  89.7  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  30.36 
 
 		 337 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  27.27 
 
 		 299 aa  88.2  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  28.61 
 
 		 337 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  29.79 
 
 		 298 aa  87  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  29.21 
 
 		 366 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  29.21 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  29.21 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  30.55 
 
 		 350 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  28.07 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  27.17 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  26.41 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  32.13 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>