173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12120 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  100 
 
 		 418 aa  852    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  76.74 
 
 		 418 aa  645    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  77.4 
 
 		 417 aa  652    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  77.4 
 
 		 417 aa  652    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  76.79 
 
 		 418 aa  645    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  77.4 
 
 		 417 aa  652    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  76.68 
 
 		 417 aa  649    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  74.52 
 
 		 417 aa  632  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  66.99 
 
 		 414 aa  584  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  63.09 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  62.53 
 
 		 416 aa  511  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  57.97 
 
 		 397 aa  482  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  56.12 
 
 		 408 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  55.73 
 
 		 410 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  54.78 
 
 		 410 aa  448  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  53.86 
 
 		 410 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  53.38 
 
 		 406 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  53.25 
 
 		 409 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  53.38 
 
 		 412 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  53.38 
 
 		 412 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  53.38 
 
 		 412 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  53.14 
 
 		 410 aa  440  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  54.39 
 
 		 409 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  53.12 
 
 		 409 aa  436  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  53.85 
 
 		 410 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  52.27 
 
 		 410 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  52.76 
 
 		 410 aa  429  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  51.69 
 
 		 410 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  53.5 
 
 		 409 aa  430  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  53.11 
 
 		 420 aa  428  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  52.51 
 
 		 411 aa  428  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  50.95 
 
 		 451 aa  420  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  50.97 
 
 		 409 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  50.97 
 
 		 409 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  51.44 
 
 		 409 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  52.04 
 
 		 408 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  52.42 
 
 		 409 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  50.48 
 
 		 409 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  52.42 
 
 		 409 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  52.17 
 
 		 409 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  48.43 
 
 		 423 aa  392  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.117842 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  49.15 
 
 		 411 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  48.3 
 
 		 426 aa  383  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0986635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  44.67 
 
 		 401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  37.97 
 
 		 393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2612  formamidase  53.68 
 
 		 206 aa  216  9e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0583639  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  35.26 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  32.82 
 
 		 459 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  30.45 
 
 		 318 aa  146  8.000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  32.2 
 
 		 322 aa  144  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  30.61 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  28.8 
 
 		 319 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  28.8 
 
 		 319 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  28.53 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  26.86 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  27.08 
 
 		 315 aa  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3454  formamidase  28.87 
 
 		 224 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172386  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  26.04 
 
 		 314 aa  96.7  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  26.58 
 
 		 313 aa  93.6  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  26.91 
 
 		 314 aa  93.2  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  27.08 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  29.57 
 
 		 315 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  34.91 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  29.63 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  34.6 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  30.29 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  31.05 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  27.9 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  27.94 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  25.36 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  26.62 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 		 481 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  30.59 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  27.1 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  26.64 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  27.16 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  30.12 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  25.74 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  33.73 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  26.22 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  26.82 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  28.79 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  28.05 
 
 		 484 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  28.95 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  23.75 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  27.27 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  27.27 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  24.49 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  25.66 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  26.11 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  24.49 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  26.92 
 
 		 363 aa  69.7  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  25.39 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  31.68 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  26.11 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  26.11 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  26.11 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  26.98 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  34.39 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  27.36 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>