178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5673 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  82.4 
 
 
410 aa  703    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  81.42 
 
 
409 aa  687    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  82.6 
 
 
409 aa  683    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  82.84 
 
 
409 aa  719    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  82.93 
 
 
410 aa  720    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  88.51 
 
 
410 aa  762    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  83.09 
 
 
409 aa  687    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  99.76 
 
 
412 aa  847    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  83.41 
 
 
410 aa  698    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  99.76 
 
 
412 aa  847    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  77.94 
 
 
410 aa  664    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  83.62 
 
 
409 aa  709    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  80.44 
 
 
409 aa  698    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  74.88 
 
 
410 aa  666    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  83.09 
 
 
409 aa  716    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  80.39 
 
 
409 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  100 
 
 
412 aa  849    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  83.37 
 
 
410 aa  717    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  83.82 
 
 
409 aa  723    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  80.44 
 
 
409 aa  698    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  80.2 
 
 
409 aa  683    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  71.18 
 
 
411 aa  627  1e-179  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  75.55 
 
 
410 aa  624  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  69.85 
 
 
406 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  67.74 
 
 
408 aa  568  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  69.92 
 
 
408 aa  550  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  61.73 
 
 
397 aa  503  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  58.68 
 
 
415 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  58.21 
 
 
416 aa  491  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  57.99 
 
 
414 aa  491  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0111175 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  56.38 
 
 
411 aa  462  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  55.77 
 
 
417 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  55.77 
 
 
417 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  53.86 
 
 
451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  55.77 
 
 
417 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  55.8 
 
 
417 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  56.3 
 
 
418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  52.53 
 
 
426 aa  441  9.999999999999999e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0986635 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  56.16 
 
 
418 aa  440  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  53.38 
 
 
418 aa  441  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  54.57 
 
 
417 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  54.09 
 
 
423 aa  427  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.117842 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  49.88 
 
 
420 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  48.17 
 
 
401 aa  327  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2612  formamidase  58.24 
 
 
206 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0583639  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  37.98 
 
 
393 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  31.09 
 
 
459 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  34.01 
 
 
388 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  31.32 
 
 
318 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  30.87 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  29.11 
 
 
328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  29.81 
 
 
315 aa  113  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  30.08 
 
 
319 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  30.08 
 
 
319 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  26.72 
 
 
312 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  29.54 
 
 
319 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  26.46 
 
 
312 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  28.88 
 
 
314 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  28.93 
 
 
314 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3454  formamidase  30.11 
 
 
224 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  26.51 
 
 
313 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  31.92 
 
 
418 aa  93.2  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  29.23 
 
 
314 aa  90.1  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  26.65 
 
 
438 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  26.65 
 
 
438 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  26.96 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  30.18 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  28.69 
 
 
304 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  28.67 
 
 
373 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  25.42 
 
 
301 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  27.89 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  27.89 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  27.89 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  28.69 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  27.49 
 
 
304 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  27.49 
 
 
303 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  27.09 
 
 
304 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  27.49 
 
 
303 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  30.43 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  28.76 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  28.8 
 
 
454 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  26.67 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  30.34 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  25.41 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  29.08 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  29.08 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  26 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  29.08 
 
 
416 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  25 
 
 
439 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  27.54 
 
 
305 aa  72.8  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  32.75 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  28.06 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  31.27 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  26.25 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  28.23 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
810 aa  70.5  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  29.59 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  31.22 
 
 
791 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  23.89 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  26.51 
 
 
328 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.841044 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>