59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3454 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3454  formamidase  100 
 
 		 224 aa  430  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172386  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  32.89 
 
 		 397 aa  122  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  34.01 
 
 		 416 aa  122  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  33.22 
 
 		 414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  30.39 
 
 		 409 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  31.91 
 
 		 411 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  30.2 
 
 		 406 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  31.49 
 
 		 415 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  30.69 
 
 		 420 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  29.6 
 
 		 410 aa  104  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  30.11 
 
 		 412 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  30.41 
 
 		 417 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  28.76 
 
 		 418 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  30.11 
 
 		 412 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  30.11 
 
 		 412 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  30.36 
 
 		 409 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  30.36 
 
 		 409 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  30.11 
 
 		 409 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  30.28 
 
 		 410 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  29.75 
 
 		 410 aa  98.2  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  30.36 
 
 		 409 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  30.36 
 
 		 410 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  30 
 
 		 409 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  29.03 
 
 		 409 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  29.39 
 
 		 410 aa  95.5  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  28.32 
 
 		 410 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  29.64 
 
 		 410 aa  94  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  29.79 
 
 		 417 aa  93.6  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  31.97 
 
 		 417 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  31.97 
 
 		 417 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  31.97 
 
 		 417 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  29.15 
 
 		 451 aa  93.2  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  27.53 
 
 		 408 aa  93.2  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  27.24 
 
 		 408 aa  92  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  28.77 
 
 		 418 aa  91.7  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  28.21 
 
 		 409 aa  89.7  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  27.44 
 
 		 411 aa  87.8  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  27.17 
 
 		 410 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  26.88 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  26.62 
 
 		 426 aa  79.3  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0986635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  28.07 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  28.07 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  28.42 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  25.77 
 
 		 423 aa  68.9  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.117842 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2612  formamidase  28.65 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0583639  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  41.89 
 
 		 418 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  28.46 
 
 		 393 aa  52.4  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  23.58 
 
 		 322 aa  52.4  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  24.78 
 
 		 318 aa  50.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  28.05 
 
 		 303 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  32.48 
 
 		 479 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  33.57 
 
 		 381 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  25.7 
 
 		 312 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  31.85 
 
 		 443 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  31.01 
 
 		 304 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  29.23 
 
 		 304 aa  42.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  25.7 
 
 		 312 aa  42.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  26.28 
 
 		 373 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  31.01 
 
 		 304 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>