177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0981 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  73.9 
 
 		 410 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  78.29 
 
 		 409 aa  680    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  74.88 
 
 		 412 aa  666    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  78.78 
 
 		 410 aa  661    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  79.71 
 
 		 409 aa  659    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  76.34 
 
 		 410 aa  672    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  76.1 
 
 		 410 aa  673    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  80.2 
 
 		 409 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  74.88 
 
 		 412 aa  666    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  77.56 
 
 		 409 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  74.88 
 
 		 412 aa  666    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  78.97 
 
 		 409 aa  685    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  100 
 
 		 410 aa  841    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  79.02 
 
 		 409 aa  664    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  77.56 
 
 		 409 aa  652    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  78.73 
 
 		 409 aa  665    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  77.32 
 
 		 409 aa  665    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  78.05 
 
 		 410 aa  677    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  77.51 
 
 		 409 aa  677    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  77.32 
 
 		 409 aa  665    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  69.53 
 
 		 411 aa  622  1e-177  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  71.88 
 
 		 410 aa  623  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  72.44 
 
 		 410 aa  591  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  69.17 
 
 		 406 aa  585  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  68.56 
 
 		 408 aa  574  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  68.34 
 
 		 408 aa  528  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  62.6 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  60.69 
 
 		 414 aa  507  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  57.11 
 
 		 416 aa  479  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  56.9 
 
 		 415 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  58.87 
 
 		 417 aa  471  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  57.35 
 
 		 451 aa  464  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  56.78 
 
 		 411 aa  463  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  57.35 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  57.35 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  57.88 
 
 		 417 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  57.14 
 
 		 417 aa  458  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  55.98 
 
 		 418 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  54.78 
 
 		 418 aa  448  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  57 
 
 		 418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  52.29 
 
 		 426 aa  434  1e-120  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0986635 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  53.47 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.117842 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  51.79 
 
 		 420 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  47.63 
 
 		 401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2612  formamidase  57.14 
 
 		 206 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0583639  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  35.71 
 
 		 393 aa  186  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  33.16 
 
 		 388 aa  155  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  30.77 
 
 		 459 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  30.59 
 
 		 318 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  29.12 
 
 		 322 aa  126  7e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  27.47 
 
 		 328 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  29.27 
 
 		 315 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  30.11 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  30.11 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  30.08 
 
 		 319 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  28.18 
 
 		 314 aa  99.8  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  27.47 
 
 		 314 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3454  formamidase  29.64 
 
 		 224 aa  94  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172386  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  27.3 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  27.03 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  26.3 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  26.3 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  26.3 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  30.15 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  29.78 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  29.27 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  26.94 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  29.7 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  28.5 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  29.79 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  26.35 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  32.91 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  29.08 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  31.48 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  30.47 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  27.56 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  31.16 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  29.46 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  27.67 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  25.4 
 
 		 324 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  27.3 
 
 		 347 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  26.97 
 
 		 301 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  27.81 
 
 		 315 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  28.35 
 
 		 479 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  30.58 
 
 		 343 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  28.17 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  26.4 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  29.37 
 
 		 479 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  30.34 
 
 		 485 aa  72  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  26.1 
 
 		 498 aa  71.6  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  28.61 
 
 		 479 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  26.8 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  27.69 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  27.8 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  27.8 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  31.62 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  27.03 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  32.26 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  26.76 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  26.76 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>