175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54476 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  100 
 
 		 451 aa  930    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  59.28 
 
 		 397 aa  492  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  54.24 
 
 		 406 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  52.83 
 
 		 411 aa  462  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  57.35 
 
 		 410 aa  464  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  54.35 
 
 		 409 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  54.35 
 
 		 409 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  54.11 
 
 		 409 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  55.18 
 
 		 408 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  55.11 
 
 		 414 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  53.62 
 
 		 409 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  53.86 
 
 		 412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  53.86 
 
 		 412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  53.86 
 
 		 410 aa  451  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  54.27 
 
 		 408 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  55.05 
 
 		 411 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  53.86 
 
 		 412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  54.83 
 
 		 409 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  53.14 
 
 		 410 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  53.38 
 
 		 410 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  54.11 
 
 		 409 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  52.83 
 
 		 416 aa  445  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  53.55 
 
 		 415 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  52.17 
 
 		 410 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  53.86 
 
 		 409 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  53.86 
 
 		 410 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  52.66 
 
 		 409 aa  436  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  54.59 
 
 		 409 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  52.17 
 
 		 410 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  51.9 
 
 		 417 aa  431  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  51.93 
 
 		 410 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  52.56 
 
 		 409 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  50.95 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  53.86 
 
 		 409 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  49.88 
 
 		 426 aa  420  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0986635 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  50.95 
 
 		 418 aa  420  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  51.9 
 
 		 417 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  51.9 
 
 		 417 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  51.9 
 
 		 417 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  50.71 
 
 		 417 aa  414  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  50 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.117842 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  50.12 
 
 		 420 aa  398  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  50.35 
 
 		 418 aa  398  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  43.98 
 
 		 401 aa  302  7.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2612  formamidase  56.1 
 
 		 206 aa  237  4e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0583639  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  35.06 
 
 		 393 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  33.83 
 
 		 388 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  29.9 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  30.71 
 
 		 318 aa  145  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  28.36 
 
 		 322 aa  140  4.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  26.6 
 
 		 319 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  26.6 
 
 		 319 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3454  formamidase  28.97 
 
 		 224 aa  89.7  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172386  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  26.6 
 
 		 319 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  33.89 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  32.65 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  31.67 
 
 		 313 aa  79.7  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  26.1 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  28.47 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  30.73 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  32.74 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  25.82 
 
 		 454 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  23.86 
 
 		 491 aa  66.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  27.07 
 
 		 479 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  26.67 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  26.71 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  23.52 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  27.39 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  23.5 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  30.05 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  48.39 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  26.64 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  26.23 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  26.23 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  28.12 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  22.67 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  31.58 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  26.49 
 
 		 324 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  32.02 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  22.38 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  28.44 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  22.38 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  44.93 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  23.95 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  26.64 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  42.31 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 791 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  27.47 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  25.88 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  28.93 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  29.75 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  39.44 
 
 		 303 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  39.44 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  39.44 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  39.44 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 791 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  40.62 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  60.47 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>