79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2612 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2612  formamidase  100 
 
 		 206 aa  423  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0583639  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  63.55 
 
 		 397 aa  270  9e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  62.57 
 
 		 406 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  60.94 
 
 		 416 aa  242  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  58.73 
 
 		 415 aa  239  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  59.07 
 
 		 410 aa  238  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  58.6 
 
 		 420 aa  236  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  56.1 
 
 		 451 aa  237  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  61.2 
 
 		 408 aa  234  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  59.34 
 
 		 411 aa  231  5e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  59.34 
 
 		 408 aa  231  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  59.89 
 
 		 409 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  58.24 
 
 		 410 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  58.24 
 
 		 410 aa  225  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  57.21 
 
 		 410 aa  223  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  54.5 
 
 		 409 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  58.79 
 
 		 409 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  54.5 
 
 		 409 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  54.5 
 
 		 409 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  54.5 
 
 		 409 aa  221  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  58.24 
 
 		 412 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  58.24 
 
 		 412 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  58.24 
 
 		 412 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  57.14 
 
 		 410 aa  221  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  54.5 
 
 		 414 aa  221  8e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  57.14 
 
 		 409 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  54.74 
 
 		 417 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  55.26 
 
 		 417 aa  217  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  53.68 
 
 		 418 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  56.28 
 
 		 409 aa  215  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  54.64 
 
 		 410 aa  214  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  56.59 
 
 		 410 aa  214  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  57.14 
 
 		 410 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  60.99 
 
 		 409 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  53.68 
 
 		 418 aa  210  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  60.99 
 
 		 409 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  51.18 
 
 		 417 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  51.18 
 
 		 417 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  51.18 
 
 		 417 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  60.44 
 
 		 409 aa  207  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  53.16 
 
 		 418 aa  206  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  54.6 
 
 		 411 aa  206  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  53.63 
 
 		 423 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.117842 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  48.97 
 
 		 426 aa  187  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0986635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  43.1 
 
 		 401 aa  145  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  37.74 
 
 		 393 aa  112  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  33.96 
 
 		 328 aa  93.2  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  31.61 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  31.29 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  31.72 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  34.09 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  34.81 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  34.09 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  32.58 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  30.61 
 
 		 319 aa  61.6  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  30.61 
 
 		 319 aa  61.6  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  33.93 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  30.61 
 
 		 319 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  30.6 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  29.1 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3454  formamidase  30 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172386  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  28.03 
 
 		 314 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  33.91 
 
 		 301 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  30.43 
 
 		 439 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  32.63 
 
 		 330 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  34.67 
 
 		 329 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  38.89 
 
 		 329 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  37.5 
 
 		 329 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  30.38 
 
 		 350 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  39.34 
 
 		 291 aa  43.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  30.91 
 
 		 479 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  30.56 
 
 		 303 aa  43.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  28.24 
 
 		 347 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  51.28 
 
 		 312 aa  42  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  26 
 
 		 311 aa  41.6  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  32 
 
 		 304 aa  41.6  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  34.52 
 
 		 305 aa  41.6  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  31.25 
 
 		 303 aa  41.6  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  31.48 
 
 		 443 aa  41.6  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>