More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6385 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  99.43 
 
 		 350 aa  707    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  88.29 
 
 		 350 aa  641    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 350 aa  712    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 350 aa  712    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5718  AraC family transcriptional regulator  92.29 
 
 		 350 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  92 
 
 		 350 aa  621  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  33.13 
 
 		 382 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0210  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 382 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.278356  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4632  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1831  transcriptional regulator, AraC family  30.13 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1049  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 391 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0294  putative transcription regulator protein  30.25 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.785929  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5238  helix-turn-helix domain-containing protein  40.72 
 
 		 348 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  32.6 
 
 		 309 aa  109  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  29.15 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  29.15 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5039  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2366  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0234  transcriptional regulator, AraC family  32.18 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3881  transcriptional regulator, AraC family  29.78 
 
 		 335 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0127  AraC family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0237  transcriptional regulator, AraC family  29.96 
 
 		 331 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2016  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.875344  normal  0.643509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4055  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  27.07 
 
 		 330 aa  94.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0550  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 373 aa  92.8  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  27.12 
 
 		 344 aa  93.2  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0481  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 373 aa  92.8  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974899  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2758  helix-turn-helix domain-containing protein  28.62 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2146  transcriptional regulator, AraC family  27.51 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  28.77 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2016  helix-turn-helix, AraC type  27.11 
 
 		 337 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  29.06 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4409  helix-turn-helix domain-containing protein  24.71 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2287  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0383209 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3438  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7239  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  25.85 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  26.09 
 
 		 791 aa  79.3  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2626  transcriptional regulator, AraC family  25.7 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000849178  hitchhiker  0.00271101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2585  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.168038  normal  0.493972 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0584  transcriptional regulator, AraC family  29.05 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 322 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.63 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  25.4 
 
 		 288 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1604  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  41.24 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  30.67 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  26.18 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  26.89 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0512  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2978  AraC family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 777 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  26.94 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1517  AraC family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000450911  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0556  AraC family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0696213  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0770  AraC family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2058  AraC family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2088  AraC family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  26.74 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2148  AraC-type DNA-binding domain-containing proteins  44.21 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  32.59 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  32.58 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  30.35 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  29.19 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>