More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3108 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 344 aa  706    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 350 aa  179  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 350 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5718  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 350 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 350 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0294  putative transcription regulator protein  36.04 
 
 		 352 aa  155  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.785929  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2758  helix-turn-helix domain-containing protein  36.21 
 
 		 350 aa  145  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0210  transcriptional regulator, AraC family  30.55 
 
 		 382 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.278356  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0550  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0481  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974899  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1831  transcriptional regulator, AraC family  29.23 
 
 		 352 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  25.91 
 
 		 382 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4632  transcriptional regulator, AraC family  27.93 
 
 		 380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4055  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3438  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 352 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480484 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  32.27 
 
 		 338 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  31.88 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  32.27 
 
 		 338 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2146  transcriptional regulator, AraC family  31.44 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0127  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 332 aa  119  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  29.6 
 
 		 344 aa  119  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4409  helix-turn-helix domain-containing protein  29.92 
 
 		 386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5238  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2366  transcriptional regulator, AraC family  31.3 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0234  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0237  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 331 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2016  helix-turn-helix, AraC type  29.69 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3881  transcriptional regulator, AraC family  29.24 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1049  transcriptional regulator, AraC family  26.99 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7239  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2585  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 339 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.168038  normal  0.493972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  29.48 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  29.48 
 
 		 334 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 351 aa  99  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 347 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 368 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  25.45 
 
 		 340 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 352 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 346 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 346 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 346 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 318 aa  96.7  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  30.8 
 
 		 318 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5039  AraC family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 333 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0584  transcriptional regulator, AraC family  27.8 
 
 		 351 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 321 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2287  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0383209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  29.92 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.62 
 
 		 304 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 318 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2016  AraC family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 375 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.875344  normal  0.643509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  26.4 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0512  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 343 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  29.84 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  34.18 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  27.95 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  31.35 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4875  AraC family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0955854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  27.76 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 791 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  27.44 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  27.44 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2978  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 313 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  27.84 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  27.56 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  26.02 
 
 		 791 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 777 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  26.81 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0488  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 186 aa  72.4  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  29.09 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>