More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4762 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  100 
 
 		 353 aa  719    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 342 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6715  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  41.88 
 
 		 347 aa  186  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.383418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  32.79 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 333 aa  142  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 329 aa  135  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 305 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  29.38 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3807  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.13417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  29.21 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 317 aa  113  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 324 aa  107  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  29.11 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 347 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  27.96 
 
 		 318 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 791 aa  97.4  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 327 aa  97.8  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  28.13 
 
 		 325 aa  97.8  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  26.03 
 
 		 288 aa  94.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  27.22 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  48 
 
 		 777 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1779  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.255898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 354 aa  90.5  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 346 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 346 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 346 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  35.02 
 
 		 791 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1604  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 791 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 316 aa  86.3  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1512  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  26.51 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0534  transcriptional regulator, AraC family  26.88 
 
 		 261 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4632  transcriptional regulator, AraC family  26.58 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  28.44 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  40.78 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4450  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  0.0834018 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0488  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  44.76 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  23.97 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  24.84 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3156  AraC family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  42.86 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.57 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.49 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  25.33 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.69 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  25.91 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  25.91 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  24.81 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.81 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  24.81 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  24.42 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1695  transcriptional regulator, AraC family  25.8 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.81 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2090  helix-turn-helix domain-containing protein  34.3 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.639887  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  24.42 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  27.36 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 326 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 326 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 326 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.42 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5718  AraC family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>